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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004974`

染色体: Chr02 坐标: 71629200-71630802 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004974`
名称	SmilChr02G004974
描述	uncharacterized SmilChr02G004974
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71629200 - 71630802 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008977`
GeneID	`131008977`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008977`
原始查询	`LOC131008977`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox638; symbol=OsFbox638; hit=Os12g0128000; species=rice; confidence=low
产物	OsFbox638; symbol=OsFbox638; hit=Os12g0128000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G40920` (AT2G40920) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818689] identity=23.4; qcov=0.612; evalue=7.64e-07; confidence=weak
Rice	`Os12g0128000` (OsFbox638) - identity=25.7; qcov=0.686; evalue=5.27e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008977

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057792119.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057792119.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792119.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792119.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792119.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71629522`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B98
`Chr2:71629522`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B98
`Chr2:71629523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B73
`Chr2:71629683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:71629788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C71
`Chr2:71629879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B108,C23
`Chr2:71629898`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A9,B13,B136,B140,B60,B73,B79
`Chr2:71629904`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A9,B13,B136,B140,B60,B73,B79
`Chr2:71630037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B108,C23
`Chr2:71630246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792119.1

369 aa

184

369

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 75-347 aa PF07734 FBA_1 90-286 aa

XP_057792120.1

369 aa

184

369

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 75-347 aa PF07734 FBA_1 90-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792119.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	75	347	1.6e-12	47.8	F-box associated beta propeller domain
`XP_057792119.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	90	286	9.8e-10	38.6	F-box associated beta propeller domain
`XP_057792120.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	75	347	1.6e-12	47.8	F-box associated beta propeller domain
`XP_057792120.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	90	286	9.8e-10	38.6	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936136.1
GTTGTCGTTTTTGGTTACGTGATGACAATGAGAACAAAAACCCCGAAACATGCAAGTGCCACAACCAATTCTAATTGAACAGAAACATGAGTAAGAGTTCTATTACAACTACTATTTAATTAATTTGATTACTACAGTATAAACAAGTCGATTCCTACTCAAGTTCTAAAACAAACTAATTATTATATATAATACCAATATATGGTATAATAATATCTTCACGCACAAATTCATCGCCGATAGCAGAGACACATTATTTC...

XM_057936137.1
GTTGTCGTTTTTGGTTACGTGATGACAATGAGAACAAAAACCCCGAAACATGCAAGTGCCACAACCAATTCTAATTGAACAGAAACATGAGTAAGAGTTCTATTACAACTACTATTTAATTAATTTGATTACTACAGTATAAACAAGTCGATTCCTACTCAAGTTCTAAAACAAACTAATTATTATATATAATACCAATATATGGTATAATAATATCTTCACGCACAAATTCATCGCCGATAGCAGAGACACATTATTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008977
ATGAAGTCTGAATGCTTTTCTTGGATCACTCAAATTCTCAACAAAATTAGAGGCAACAATGATGATTACTTTGCATATGAGGACGAAACATCAATCCTATTAAAGAAGCGCCCTCTTCTTCTCCAACCTCCCAAACCCCAGCCGCGCCGCCGCCGACCCCCGATCCTCCGCTACTTCTGCCCTAAAAATCTCCGCCTCTACATCATCGACGGCGACTCGGAGAAGGAGTGCAAGCTTCCCGGCGGCGGATTCAAAAACGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792119.1
MKSECFSWITQILNKIRGNNDDYFAYEDETSILLKKRPLLLQPPKPQPRRRRPPILRYFCPKNLRLYIIDGDSEKECKLPGGGFKNATFVASCNGLVLLSSTHRDRIQYGVFNPLSDEAITIIQPPAGIPTPQPCAFFFHPGAKEHRILAVGGKRDPDLGYEYQIYSFQTRRWRPIANPYFRFRPWKSELDSVDGSPAAANGALHWYTGVITVFDVMSEELTVKVLPFVDYLLKLVYFNGYLVTRGEEEELCFCVVGRRE...

XP_057792120.1
MKSECFSWITQILNKIRGNNDDYFAYEDETSILLKKRPLLLQPPKPQPRRRRPPILRYFCPKNLRLYIIDGDSEKECKLPGGGFKNATFVASCNGLVLLSSTHRDRIQYGVFNPLSDEAITIIQPPAGIPTPQPCAFFFHPGAKEHRILAVGGKRDPDLGYEYQIYSFQTRRWRPIANPYFRFRPWKSELDSVDGSPAAANGALHWYTGVITVFDVMSEELTVKVLPFVDYLLKLVYFNGYLVTRGEEEELCFCVVGRRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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