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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004930`

染色体: Chr02 坐标: 71303865-71307149 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004930`
名称	SmilChr02G004930
描述	DAR GTPase 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71303865 - 71307149 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008978`
GeneID	`131008978`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008978`
原始查询	`LOC131008978`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DAR GTPase 2, mitochondrial-like
产物	DAR GTPase 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G10650` (AT4G10650) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826658] identity=55.1; qcov=1; evalue=3.69e-126; confidence=high
Rice	`Os10g0572000` - identity=48; qcov=1; evalue=6.14e-102; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	-
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008978

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057792121.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057792121.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792121.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792121.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792121.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71304112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B35,C48,C82
`Chr2:71304295`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	48	A1,A10,A16,A20,A21,A4,B104,B108,B117,B119,B122,B129,B130,B131,B138,B18,B2,B22,B28,B35,B39,B4,B41,B44,B46,B51,B56,B62,B68,B70,B75,B76,B96,C12,C20,C23,C27,C33,C36,C42,C46,C48,C54,C65,C71,C77,C85,D4
`Chr2:71304357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr2:71304365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr2:71304383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr2:71304422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr2:71304760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B53,C32,C48,C68
`Chr2:71304788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr2:71304810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B101,B97
`Chr2:71305178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:71305365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B127,C13
`Chr2:71305420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792121.1

367 aa

184

367

MMR_HSR1

PF01926 MMR_HSR1 140-207 aa

XP_057792122.1

341 aa

170

341

MMR_HSR1

PF01926 MMR_HSR1 114-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792121.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	140	207	1.4e-08	35.6	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057792122.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	114	181	1.2e-08	35.7	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936138.1
ATATATATTATAAATTTGTAAATTATACTAATAATTATTTGAAATTGAAGTCCTATATTTCTAATTCTGCAATTGGAAGAACTTCCAGACCCCCCGTTGCTGAACTACCGCCCTACCTCCTCTATCTCATCTCTCGTCGGCGACGCCGCCGCAAGTCCCCCGTGCCGCTGCCCTCCTACGCGACCTCGTAAATCGCCAGACTCCAGTTTCGCCGCTCCGCCACGAGCCGCCGCTCGCAACTCACGCACATGTGATGCTGG...

XM_057936139.1
GCAATTGGAAGAACTTCCAGACCCCCCGTTGCTGAACTACCGCCCTACCTCCTCTATCTCATCTCTCGTCGGCGACGCCGCCGCAAGTCCCCCGTGCCGCTGCCCTCCTACGCGACCTCGTAAATCGCCAGACTCCAGTTTCGCCGCTCCGCCACGAGCCGCCGCTCGCAACTCACGCACATGTGATGCTGGGAATCATGACGTGATTTTTATACCCAAATAACCGCATCGGTTATTGGGCAACCGATCATCCCAAACGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008978
ATGGCGGCAAGAGAGCGTGTATTTGGAGCCATTGGAAAATCAGTGAAGGCGGTGGCGAAAAGCAGAGGCTCCGAGTGGTGGTACACTCCTCACATGGCGGCCGCTGCCCGCGCCATAGAGGAGCGCATCCCACTCGTCGATCTTATTCTCGAAGTGAGAGATGCCCGGATTCCATTATCATCGGAATATTTGCAATTGAGGAAGATTCCTTCCGCTTGCCGGATCATTGTGCTGAATAAGGCGGACCTTGCTGATCGCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792121.1
MAARERVFGAIGKSVKAVAKSRGSEWWYTPHMAAAARAIEERIPLVDLILEVRDARIPLSSEYLQLRKIPSACRIIVLNKADLADRSQTKEWLRFFEKQKCMAFGVNSHNRDNIREFLTFLQARVRELKKKDDRAHVITLMLVGIPNVGKSALANSLHQVGRISAAEKGRLKHSVVTPQPGETKSISSLKIASHPNIFVLDTPSVLPPDVIDDEVCSKLAVTGAIKDSVAGEINLAEYFLSILNLGEEYKKWAKLSSSEA...

XP_057792122.1
MAARERVFGAIGKSVKAVAKSRGSEWWYTPHMAAAARAIEERIPLVDLILEVRDARIPLSSEYLQLRKIPSACRIIVLNKADLADRSQTKFLTFLQARVRELKKKDDRAHVITLMLVGIPNVGKSALANSLHQVGRISAAEKGRLKHSVVTPQPGETKSISSLKIASHPNIFVLDTPSVLPPDVIDDEVCSKLAVTGAIKDSVAGEINLAEYFLSILNLGEEYKKWAKLSSSEAGVALTGDGSLSLGKKQKKKYPTDHTQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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