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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004929`

染色体: Chr02 坐标: 71296243-71300602 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004929`
名称	SmilChr02G004929
描述	peroxisome biogenesis protein 16
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71296243 - 71300602 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008979`
GeneID	`131008979`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008979`
原始查询	`LOC131008979`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxisome biogenesis protein 16
产物	peroxisome biogenesis protein 16
Arabidopsis	`AT2G45690` (SSE1) shrunken seed protein (SSE1) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819177] identity=55.9; qcov=1.02; evalue=3.37e-143; confidence=high
Rice	`Os02g0123200` - identity=46.8; qcov=0.926; evalue=5.65e-100; confidence=high
GO	GO:0005778 (peroxisomal membrane); GO:0007031 (peroxisome organization)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08610 (Pex16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008979

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057792123.1`
2	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	1.00000	`XP_057792123.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792123.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792123.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792123.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71297793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:71298873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B138
`Chr2:71299156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:71299204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C47
`Chr2:71299216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr2:71299218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,D7
`Chr2:71299245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:71299255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B63
`Chr2:71299302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:71299329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B63
`Chr2:71299333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B61,C61
`Chr2:71299395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792123.1

367 aa

184

367

Pex16

PF08610 Pex16 2-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792123.1`	Pfam	`PF08610`	Pex16	Family	2	358	3.1e-90	303.7	Peroxisomal membrane protein (Pex16)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936140.1
ATTTGGCATCTTAGTTACGAAAAGGCCTCTGATTTCCACTCCATTTTTTTGTTAAGAAAACAAAAAACCGGTTGTTGAAGTAAATATCTGTTCATCCGTTGAAGAGTGGAGAAGCAATATGTGTCTACCTGGTGTGCGTCACGCTCACATGCTACTATAACTAAGCGGTGGATTTAGGAGTTAGGGTTCTTGAAATTTCTGCATTTAATACTCGCATAATCCTGAATTCACTTGGGCTCCTTCTGGCAAAGATTCACTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008979
ATGGAAGCTTACAAGAGATGGGTTCGGAGGAACAAAGACTACGTGCATTCTCTGGAGTCTTTAAGTAATGGTTTAACATGGCTTCTACCGGAGCGGTTCTCCGATTCAGAAATTGGACCAGAAGCAGTTACATCAATATTGGGCATTATAACCACCATCAACGACCATATAGTCGAGACAGCTCCGAGCCATACACAATCAAGGCATGTAGAAGAGCCTTCTTCTTTCCCATTCGCATTGTGCATAACTTTACTTAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792123.1
MEAYKRWVRRNKDYVHSLESLSNGLTWLLPERFSDSEIGPEAVTSILGIITTINDHIVETAPSHTQSRHVEEPSSFPFALCITLLKDLETLVEVAAQQYYGEEHKWSFMAITEAIKVLLRLAILQKSGYKMLLHGGETINDQSESDGLDSQRNALSSKPGPQGVSTILKNHQGQPPWNLEGRALSALNRFGENARTVSEPTWLRRVQHHQAVMEPSTPVAETPSLSSFLSEKGMPGGLFLTGEVMFILRPLIYVVLIRKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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