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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005024`

染色体: Chr02 坐标: 71985741-71987846 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005024`
名称	SmilChr02G005024
描述	uncharacterized SmilChr02G005024
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71985741 - 71987846 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008985`
GeneID	`131008985`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008985`
原始查询	`LOC131008985`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP-dependent DNA helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816944]; symbol=ASG1; hit=AT2G24100; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ATP-dependent DNA helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816944]; symbol=ASG1; hit=AT2G24100; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G24100` (ASG1) ATP-dependent DNA helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816944] identity=49.4; qcov=0.68; evalue=4.97e-72; confidence=high
Rice	`Os09g0128400` - identity=61.8; qcov=0.419; evalue=2.63e-62; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24818 (PH_TRF2_HOY1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792128.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057792128.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792128.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792128.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792128.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71985882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:71986021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:71986074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A21,B66,C48,D2
`Chr2:71986085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr2:71986123`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A2,A21,B107,B114,B41,B60,B66,B72,B73,B79,C24,C48,C56,C57,D2,D6
`Chr2:71986285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:71986363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B80,B84,C13,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792128.1

363 aa

182

363

PH_TRF2_HOY1

PF24818 PH_TRF2_HOY1 105-222 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792128.1`	Pfam	`PF24818`	PH_TRF2_HOY1	Domain	105	222	1e-53	181.0	TRF2/HOY1 PH-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936145.1
GATGGCGTCAGGATCTAATTAAAGTCAACCAGAGAGCCCCTTTCTCCTCTGCTTTCTTCTCTCTCTAAATTCCTGCTTGTTTCTCTCTCCTCCAAGTCCGGCTGCTTCGAGAGTCCTATATATATATAAACACCTGTATTGTATCTATATTATACAACATAAGCAAAGCGATTGAAAGCATGGGTGAGAGCGATGAGAGTGTTTTTTGGAATGGCAGAGAAGAAGACTATGCTGCTTTTTTCACATCTCACGATTTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008985
ATGGGTGAGAGCGATGAGAGTGTTTTTTGGAATGGCAGAGAAGAAGACTATGCTGCTTTTTTCACATCTCACGATTTTCAAACCAATCAAACTCCACATCAAACCATATATGATCACAATCAGGAAGGAGATGAGGAGAGTTCATCCCATTCCCATTCCCAACCCCAATCCCAGTCAACCCAAAGCCCTCTGGGGTTGACACTACGAAAAACACCATCATTCCTGAGTCTGCTGCAGAGGAGTCTCTCTCACGGCAGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792128.1
MGESDESVFWNGREEDYAAFFTSHDFQTNQTPHQTIYDHNQEGDEESSSHSHSQPQSQSTQSPLGLTLRKTPSFLSLLQRSLSHGSPGRKPDESGSAAEKLKASNFPAVFIKIGSWERATRHEGDLTAKLYYAKRKLVWEVLDGALKSKIEMQWSDISAIRAATPDNLPATLEIELKQPPLFYREINPQPRKHTLWQQASDFTGGQAPIWRRHYVTFPPGVIDKHYEKLLQCDPRLAALSQKPFPSQNSPYFDPAMLGIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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