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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005009`

染色体: Chr02 坐标: 71896415-71899445 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005009`
名称	SmilChr02G005009
描述	uncharacterized SmilChr02G005009
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71896415 - 71899445 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008994`
GeneID	`131008994`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008994`
原始查询	`LOC131008994`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00505 (HMG_box); PF01388 (ARID); PF09011 (HMG_box_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008994

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792139.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792139.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792139.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792139.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792139.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71896670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B138
`Chr2:71896671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B96,C11,C19,C69
`Chr2:71896681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C1,C41
`Chr2:71896750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,D3
`Chr2:71897458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B138
`Chr2:71897459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:71897779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:71897858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B96,C11,C19,C69
`Chr2:71899346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45
`Chr2:71899366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B6,B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792139.1

341 aa

170

341

ARID

HMG_box_2

HMG_box

PF01388 ARID 27-109 aa PF09011 HMG_box_2 197-268 aa PF00505 HMG_box 200-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792139.1`	Pfam	`PF01388`	ARID	Domain	27	109	1.1e-12	48.9	ARID/BRIGHT DNA binding domain
`XP_057792139.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	197	268	1.2e-07	33.0	HMG-box domain
`XP_057792139.1`	Pfam	`PF00505`	HMG_box	Domain	200	267	1.8e-06	29.0	HMG (high mobility group) box

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936156.1
AAACAAGTATAGTGGGAAAGTCAAAATCCTAAAAGCAGCCCAAAGAAACCGAAAACAGGTGATTTTCCGGCGGAAATGGCGAAGCAAGCCGGAGGAGCCGGTGATTTTCCCGGAGAATCAGCAGTAATTTCCACCAATGAAAAGGTGGATGTGAATCTTTTCTATGAAAAACTAGACAAACTGAACGAGTCGTCTGGCCTCACTTTACTCTTCAATTTTCGTCAAGCAATGTTGGATTTGCATCGTTTCTACATGGAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008994
ATGGCGAAGCAAGCCGGAGGAGCCGGTGATTTTCCCGGAGAATCAGCAGTAATTTCCACCAATGAAAAGGTGGATGTGAATCTTTTCTATGAAAAACTAGACAAACTGAACGAGTCGTCTGGCCTCACTTTACTCTTCAATTTTCGTCAAGCAATGTTGGATTTGCATCGTTTCTACATGGAAGTGATCAAACGAGGAGGATTTTATCAGGTGACTAAAAAGGGAAAATGGGATGATGTTGCACTAGTATCAAACTCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792139.1
MAKQAGGAGDFPGESAVISTNEKVDVNLFYEKLDKLNESSGLTLLFNFRQAMLDLHRFYMEVIKRGGFYQVTKKGKWDDVALVSNSRSRVSMSAAQLQKIYEMLILQYELMYCRKMPNQWPAKNSQGTFGCVASPSCSTGKRKHCDSSSPFSSVRLFDQDGRTEEKDCCEGQETVNKNSTMIISANSNVKKIIVDVPKAPQKPRTGYHIFLRLETHRLRENLGERSNSHNLRDMAVAAWRRLPEKDKLPYIEASKMDKER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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