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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002855`

染色体: Chr01 坐标: 47129976-47132734 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002855`
名称	SmilChr01G002855
描述	uncharacterized SmilChr01G002855
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47129976 - 47132734 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008997`
GeneID	`131008997`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008997`
原始查询	`LOC131008997`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0539700` - identity=40.2; qcov=0.449; evalue=2.18e-89; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008997

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792157.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792157.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792157.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792157.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792157.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47130045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr1:47130076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B34
`Chr1:47130097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr1:47130107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A21,B12,B2
`Chr1:47130107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B12,B2
`Chr1:47130123`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A11,B34,B36,B48,C15,C36,C54,C59,C64,C68
`Chr1:47130129`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A13,A2,B130,B37,B4,C23,C25,C7,C75,C84
`Chr1:47130248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:47130263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:47130389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A4,B110,B21,B26,B47,B5,B72,B94,C22,C46,C47,C64,C65,C71,D4
`Chr1:47130494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C30,C55
`Chr1:47130524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792157.1

826 aa

413

826

Helitron_like_N

PF14214 Helitron_like_N 204-386 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792157.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	204	386	1e-60	206.0	Helitron helicase-like domain at N-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936174.1
ATGGGAGAAAAGATTGATAACAGTTTGAATAGGGGAAATGCGCCTCCAGTGTTTCGCTTGCATGGTGAAAACTATCATTTAATGGGTAGTTTAATGCCGTTAGAAGGATGTAGGCCGAAGTTTGCTCATTTGTACATATACGACACTGAAAATGAAGTTGACAATAGATTGTTGTCAGTCAGACAAAAAAAAGATGTTGATGATTTGCATGCTGAGATTGTTTTGGATATTCAAAGTATGTTGGATGAGTGTAATATATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008997
ATGGGAGAAAAGATTGATAACAGTTTGAATAGGGGAAATGCGCCTCCAGTGTTTCGCTTGCATGGTGAAAACTATCATTTAATGGGTAGTTTAATGCCGTTAGAAGGATGTAGGCCGAAGTTTGCTCATTTGTACATATACGACACTGAAAATGAAGTTGACAATAGATTGTTGTCAGTCAGACAAAAAAAAGATGTTGATGATTTGCATGCTGAGATTGTTTTGGATATTCAAAGTATGTTGGATGAGTGTAATATATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792157.1
MGEKIDNSLNRGNAPPVFRLHGENYHLMGSLMPLEGCRPKFAHLYIYDTENEVDNRLLSVRQKKDVDDLHAEIVLDIQSMLDECNILVKSFRMARNKISDSNSAEVKLRLLGKRGKDGRTYNLPSVSEVAVLIVGDIDEAMGDRDIIIECKNGVLKRINELHPSYLALQYPLIFPFGDDCYREDIGFSENWGSTSRSRVSPKEYFAFRLHERQFEPPNILYCRRLFQQFVVDAYTMVESGRLKFVRTQQKKLRAELYKGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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