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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004925`

染色体: Chr02 坐标: 71267571-71269699 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004925`
名称	SmilChr02G004925
描述	cyclic dof factor 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71267571 - 71269699 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008998`
GeneID	`131008998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008998`
原始查询	`LOC131008998`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclic dof factor 1-like
产物	cyclic dof factor 1-like
Arabidopsis	`AT5G62430` (CDF1) cycling DOF factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836364] identity=43.8; qcov=0.866; evalue=9.42e-63; confidence=medium
Rice	`Os03g0169600` (RDD4) - identity=48.2; qcov=0.507; evalue=4.63e-40; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02701 (Zn_ribbon_Dof)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792156.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057792156.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792156.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792156.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792156.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71267823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr2:71267861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B106,B20,B98,C87
`Chr2:71267869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr2:71268792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:71268843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:71269052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B127
`Chr2:71269171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C67,D4
`Chr2:71269230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C51,C56
`Chr2:71269230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792156.1

335 aa

168

335

Zn_ribbon_Dof

PF02701 Zn_ribbon_Dof 104-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792156.1`	Pfam	`PF02701`	Zn_ribbon_Dof	Family	104	160	2.7e-32	111.4	Dof domain, zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936173.1
TATTTGAGTGTAAAATGACACATTAATAAAGTAGAAAATTCGTGTGTTCCGGCCCCACCAAAGTAGGGCTCAAGTTAGTTGGGGGGGGGGGGGGTAGGGGGTAAGTCATATGAGATTTTAGGATATCAAAATAATTTGTTAAAGCATTGCCATTTGCCAACACGGCTTATTTGTTATCTTTTTCTTATTTCTTGTTCATTTTCTCAAGTTTTTGGTGCTCCGTTTGACCAACCCTTGGAGAGGAATGAAGGAGCCGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008998
ATGAAGGAGCCGGAGATCAAATTGTTTGGCCGCAAGATCGTCTTACCGGACAAAGGCGGAGCTGTCGCCGCCGGCGAGTTTTCCGGCCGGAGCAGCTGCGTAAGCGACGGCGACGACCGCTGCTTGGAAGCCAGTGGAGAAAAAGGAGAGGCTCATCATGAAATCCAACTTCATGCTCTCGAGGAGCATCAAGAAGCAGAAGAGTGCGAAAGCAGGGATGAGAATGCAGAGGAGCCACGGAATCCGGCGGCGGAGTCGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792156.1
MKEPEIKLFGRKIVLPDKGGAVAAGEFSGRSSCVSDGDDRCLEASGEKGEAHHEIQLHALEEHQEAEECESRDENAEEPRNPAAESSEMDENGQQKAALKKPDKILPCPRCNSADTKFCYYNNYNIKQPRHFCKSCQRYWTAGGTMRNVPVGAGRRKNKNCRHISAAEADLGCAFGLSFGPDHEPIKRSDEPIKNGGPPPPPPPQLVMPFPMIPWNPAICPMPMPVYPAPYWPNNGWSVPWVGPALGKHSRSGDEVDKGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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