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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005059`

染色体: Chr02 坐标: 72286903-72289223 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005059`
名称	SmilChr02G005059
描述	uncharacterized SmilChr02G005059
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72286903 - 72289223 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009013`
GeneID	`131009013`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009013`
原始查询	`LOC131009013`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0140700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0140700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G04530` (TPR4) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839500] identity=40.6; qcov=0.545; evalue=3.26e-27; confidence=medium
Rice	`Os03g0140700` - identity=61.6; qcov=0.37; evalue=1.29e-38; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009013

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057792179.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057792179.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057792179.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792179.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792179.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72287191`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	107	A1,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A22,A25,A7,B10,B100,B104,B106,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B121,B125,B126,B128,B129,B131,B133,B134,B135,B136,B138,B15,B16,B17,B23,B24,B3,B30,B31,B32,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B49,B54,B58,B59,B64,B65,B68,B72,B73,B74,B76,B77,B79,B8,B85,B86,B88,B90,B92,B94,B98,C11,C12,C18,C20,C21,C25,C27,C28,C29,C3,C31,C34,C36,C38,C40,C44,C5,C50,C57,C6,C62,C67,C69,C70,C71,C75,C77,C79,C81,C83,C85,C86,C87,D1,D11,D3,D6,D7
`Chr2:72287265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr2:72287399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B3,C3,D11
`Chr2:72287417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr2:72287424`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B23,B3,C3,D11
`Chr2:72287424`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B23,B3,C3,D11
`Chr2:72287446`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B23,B3,C3,D11
`Chr2:72287446`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B23,B3,C3,D11
`Chr2:72287448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B3,C3,D11
`Chr2:72287516`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B110,B138,B31,B91,C55
`Chr2:72287516`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B110,B138,B31,B91,C55
`Chr2:72287586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C8

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936196.1
ATGCAAAATAGAGAGCTCTATCTATCGGGAGGTTCTAAAAAATTGACTTCCGCTGACCAACAAGTCCATCACCAAAATGAGTGATGGCTAATTTATATTCACAAATTCGCGACAAAACAAACTGTATGTTTAAATAAGACGATCATCATTTCCAAAAAAATTGGGTAATTATATATACAAATTAAAAAGTGTTTTGATTTGATGAGAGATCAAGAAGAAGGATAGAAGGAGAGATGATGCTAAGGAGCGCTTCCACGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009013
ATGATGCTAAGGAGCGCTTCCACGCCGTCTCTTGTTTCGTCCTTCATGGAGAGGCCCGCCGGTGCCGGCGTCAGCCCCCACCGCACCTCCAGCCAAGTATCATGCAACATCGGCCACGCGCCGGGATTCGCGGAGATCCGATCGCGGCGAGCTCAATCTGCCGGCAACTTGGAAGAGATATTGTTCAACATCGCCTTCCACGCCGGCGGCGACGCCGCCACCCTCTCCCGCCAATCGTCCAAGAGGATCAACGCGCTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792179.1
MMLRSASTPSLVSSFMERPAGAGVSPHRTSSQVSCNIGHAPGFAEIRSRRAQSAGNLEEILFNIAFHAGGDAATLSRQSSKRINALEAIPSFHSSDDGAAEAEEEEDEYEYEYAGGVRGLNGFCDVGFPGEGKMYLAAGIGVNAVAFLEEAGFGGGGGGYNRTADGYRDGGDNRGRGLSVENHFKNMLLQWPGNPLVLRNYAHFLYQRKGDLLGAEEYYSRAILADPEDGETLCEYGKLIWELHRDTERAKSYFERAIMA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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