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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004952`

染色体: Chr02 坐标: 71483243-71487460 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004952`
名称	SmilChr02G004952
描述	ras-related protein RABD1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71483243 - 71487460 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009021`
GeneID	`131009021`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009021`
原始查询	`LOC131009021`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ras-related protein RABD1
产物	ras-related protein RABD1
Arabidopsis	`AT3G11730` (ATFP8) Ras-related small GTP-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820345] identity=85.3; qcov=1.01; evalue=4.46e-128; confidence=high
Rice	`Os01g0558600` (OsRab1B2) - identity=79.1; qcov=0.995; evalue=1.99e-122; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF04670 (Gtr1_RagA); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009021

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057792192.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057792192.1`
3	Endosome	内体	1.00000	`XP_057792192.1`
4	Endosome membrane	内体膜	1.00000	`XP_057792192.1`
5	Phagosome	Phagosome	0.80000	`XP_057792192.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71487188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B95,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792192.1

202 aa

101

202

Arf

Roc

Gtr1_RagA

Ras

MMR_HSR1

PF00025 Arf 9-131 aa PF08477 Roc 10-124 aa PF04670 Gtr1_RagA 10-130 aa PF00071 Ras 10-170 aa PF01926 MMR_HSR1 11-109 aa

XP_057792193.1

202 aa

101

202

Arf

Roc

Gtr1_RagA

Ras

MMR_HSR1

PF00025 Arf 9-131 aa PF08477 Roc 10-124 aa PF04670 Gtr1_RagA 10-130 aa PF00071 Ras 10-170 aa PF01926 MMR_HSR1 11-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792192.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	9	131	2.7e-16	60.3	ADP-ribosylation factor family
`XP_057792192.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	10	124	3.6e-37	128.0	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057792192.1`	Pfam	`PF04670`	Gtr1_RagA	Domain	10	130	1.6e-05	25.2	Gtr1/RagA G protein conserved region
`XP_057792192.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	10	170	2.1e-67	226.5	Ras family
`XP_057792192.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	11	109	2.2e-05	25.2	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057792193.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	9	131	2.7e-16	60.3	ADP-ribosylation factor family
`XP_057792193.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	10	124	3.6e-37	128.0	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057792193.1`	Pfam	`PF04670`	Gtr1_RagA	Domain	10	130	1.6e-05	25.2	Gtr1/RagA G protein conserved region
`XP_057792193.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	10	170	2.1e-67	226.5	Ras family
`XP_057792193.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	11	109	2.2e-05	25.2	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936210.1
AGTCCATAGATTCCAGAAGGCATTTTCTACAAATATTTAATCCAAAATTTCCTTTACAACCAAACAAATAATAAGAGTTGAGTTGTGTTCTACTCATTCTCTCATACTTCTGTGTTCTGACCAAACACTCATAACTCTTCAAACTTTTCCGTATTCCTCTCAAGAAATCATGAGCAACGAATACGATTACTTGTTCAAGCTTCTCTTAATCGGTGACTCCTCTGTCGGCAAGTCTTGTCTTCTTCTGAGATTCGCGGATG...

XM_057936209.1
GTTTGCTTCTCTTTCCAGTTTCCTTTACAACCAAACAAATAATAAGAGTTGAGTTGTGTTCTACTCATTCTCTCATACTTCTGTGTTCTGACCAAACACTCATAACTCTTCAAACTTTTCCGTATTCCTCTCAAGAAATCATGAGCAACGAATACGATTACTTGTTCAAGCTTCTCTTAATCGGTGACTCCTCTGTCGGCAAGTCTTGTCTTCTTCTGAGATTCGCGGATGATTCGTATGTGGACAGTTACATTAGCACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009021
ATGAGCAACGAATACGATTACTTGTTCAAGCTTCTCTTAATCGGTGACTCCTCTGTCGGCAAGTCTTGTCTTCTTCTGAGATTCGCGGATGATTCGTATGTGGACAGTTACATTAGCACCATTGGAGTTGATTTTAAAATAAGGACAGTGGAGCTGGATGGGAAGACAATCAAGCTTCAGATTTGGGATACTGCTGGCCAGGAGCGGTTCCGGACTATCACTAGCAGTTACTATCGAGGAGCTCATGGGATCATTATTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792192.1
MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVKQWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVENKVVDTQTAKAFADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAGEIKKKMGNQPTANKSSASTVQIKGQPIEQKSNCCG

XP_057792193.1
MSNEYDYLFKLLLIGDSSVGKSCLLLRFADDSYVDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTEMESFNNVKQWLNEIDRYANDSVCKLLVGNKCDLVENKVVDTQTAKAFADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAGEIKKKMGNQPTANKSSASTVQIKGQPIEQKSNCCG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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