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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000315`

染色体: Chr01 坐标: 6069699-6071489 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000315`
名称	SmilChr01G000315
描述	uncharacterized SmilChr01G000315
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	6069699 - 6071489 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009032`
GeneID	`131009032`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009032`
原始查询	`LOC131009032`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543]; symbol=AT5G35695; hit=AT5G35695; species=arabidopsis; confidence=low
产物	nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543]; symbol=AT5G35695; hit=AT5G35695; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=57.9; qcov=0.441; evalue=1.08e-67; confidence=low
Rice	`Os08g0106900` - identity=43.4; qcov=0.647; evalue=3.1e-67; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009032

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792247.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057792247.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792247.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792247.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792247.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:6069699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:6069728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B20,C58
`Chr1:6069738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B122
`Chr1:6069787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B6,B73,C38
`Chr1:6069789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A13,A25,A7,B44,B79,B81,B84,B97,B98,C56,C59,C60,D9
`Chr1:6069799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C12,C31,C43,D8
`Chr1:6069812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	59	A10,A14,A19,A6,A7,B105,B109,B111,B113,B114,B117,B127,B133,B137,B138,B25,B28,B36,B5,B50,B55,B57,B66,B71,B72,B73,B74,B76,B78,B83,B88,B9,B95,C11,C14,C15,C17,C19,C22,C27,C30,C39,C40,C41,C5,C50,C53,C64,C69,C7,C70,C73,C76,C79,C8,C87,D4,D6,D9
`Chr1:6069827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A11,B103,B140,B16,C12,C32,C38,C57,C68
`Chr1:6069844`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A13,C4
`Chr1:6069844`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A13,C4
`Chr1:6069866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:6069869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792247.1

431 aa

216

431

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF01609 DDE_Tnp_1 187-333 aa PF13359 DDE_Tnp_4 193-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792247.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	187	333	2e-10	41.5	Transposase DDE domain
`XP_057792247.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	193	354	2.2e-24	86.6	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936264.1
ATGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGCTGTGACAAAAATGCTAAAAAGTTCACGGCCCCGGATGAAGTATGGGATGCGTACTGTCAGGCTCACCCAAAAGATGCATACTTGCGCCATGGGAATTGTCCGGATTATGAAGACTTGGAAATTGCTATTGGAAACGGTGTGGCTGTAGGGAAAAACTCAATTGGATTGGGTAGTGCTACTGATGATAGGACATTAGGAGCTGATGAAAATAGAGCTCCGCACATAGAGGAGTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009032
ATGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGCTGTGACAAAAATGCTAAAAAGTTCACGGCCCCGGATGAAGTATGGGATGCGTACTGTCAGGCTCACCCAAAAGATGCATACTTGCGCCATGGGAATTGTCCGGATTATGAAGACTTGGAAATTGCTATTGGAAACGGTGTGGCTGTAGGGAAAAACTCAATTGGATTGGGTAGTGCTACTGATGATAGGACATTAGGAGCTGATGAAAATAGAGCTCCGCACATAGAGGAGTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792247.1
MKFNSGFGCDKNAKKFTAPDEVWDAYCQAHPKDAYLRHGNCPDYEDLEIAIGNGVAVGKNSIGLGSATDDRTLGADENRAPHIEELNYDAENEAFVGLTQDYPPSSGSKSPLVFPKVFVESTQRRAPTKRSRGQFVIRFDRSHFATSRNFNKILRALNTIAPNMMVKPTTAIPAKIRESTRFNHFFKDCIGAIDGTHIPAMVTGRDVSSYRNRHGVQSQNVLAACNFDLQFIYVLSGWEGSAHDSKLLSDTLSRPNGLHV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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