当前解析结果
SmilChr02G004965| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004965 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004965 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004965 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 71562197 - 71563395 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009046 |
|---|---|
| GeneID | 131009046 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009046 |
| 原始查询 | LOC131009046 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | multidrug resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837512]; symbol=AT1G09812; hit=AT1G09812; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | multidrug resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837512]; symbol=AT1G09812; hit=AT1G09812; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G09812 (AT1G09812)multidrug resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837512] identity=58.2; qcov=0.775; evalue=3.94e-27; confidence=medium |
| Rice | Os05g0426800- identity=42.6; qcov=0.908; evalue=2.75e-23; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009046 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057792234.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792234.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792234.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792234.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057792234.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:71562306 |
AGT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A1,A13,B117,B24,B57,C27,C53,D2 |
Chr2:71562309 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | C16,C32,C68,C81,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。