当前解析结果
SmilChr02G004998| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004998 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004998 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004998 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 71805691 - 71809570 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009051 |
|---|---|
| GeneID | 131009051 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009051 |
| 原始查询 | LOC131009051 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | OsWD40-2; symbol=OsWD40-2; hit=Os01g0141700; species=rice; confidence=low |
| 产物 | OsWD40-2; symbol=OsWD40-2; hit=Os01g0141700; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G58760 (DDB2)damaged DNA binding 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835990] identity=63.6; qcov=0.359; evalue=1.62e-10; confidence=low |
| Rice | Os01g0141700 (OsWD40-2)- identity=56.4; qcov=0.424; evalue=7.27e-11; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009051 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057792242.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057792242.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057792243.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792242.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792242.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:71806900 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,C62 |
Chr2:71807454 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B16,B8,C22 |
Chr2:71807492 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B136,C32,C68 |
Chr2:71808122 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,C23,C24 |
Chr2:71808131 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,C23,C24 |
Chr2:71809262 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B38,B63,B85,C20 |
Chr2:71809270 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,C19,C31,C46,C74 |
Chr2:71809274 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr2:71809276 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B38,B63,B85,C20 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
9 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。