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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002900`

染色体: Chr01 坐标: 47671105-47672514 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002900`
名称	SmilChr01G002900
描述	uncharacterized SmilChr01G002900
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47671105 - 47672514 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009066`
GeneID	`131009066`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009066`
原始查询	`LOC131009066`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=23.5; qcov=0.454; evalue=1.07e-12; confidence=weak
Rice	`Os12g0156200` - identity=28.9; qcov=0.42; evalue=2.02e-23; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009066

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057792251.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057792251.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792251.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792251.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792251.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47671497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr1:47671885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:47671902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,B60,C34,C63,C67
`Chr1:47671922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B102,B138,B95
`Chr1:47671923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,B60,C34,C63,C67
`Chr1:47671929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:47671977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,B60,C34,C63
`Chr1:47672045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr1:47672145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr1:47672186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B46
`Chr1:47672186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:47672281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792251.1

469 aa

234

469

DUF4283

PF14111 DUF4283 36-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792251.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	36	108	2.7e-07	30.9	Domain of unknown function (DUF4283)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936268.1
ATGGATCCGGTTGAGATTCAACGACTCGTGGATCAACTGAAACTTTCGGAGGAAGCGGACCAAGCTACGGTGCCGCTAACGTCTAAACTCACCGAGCAGTTACGGGACAAAACCAAATTCTGCCTGGCTGGGAAGGTATTCGCCAACAAACAAATTAATAGGGATTTATTGGTGACACACCTACCGAATATCCTTCAAACAACTCAGCGGGTGGATATTGAGATTGTTGGATCTAATATTTTCGTGGCTCACTTCAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009066
ATGGATCCGGTTGAGATTCAACGACTCGTGGATCAACTGAAACTTTCGGAGGAAGCGGACCAAGCTACGGTGCCGCTAACGTCTAAACTCACCGAGCAGTTACGGGACAAAACCAAATTCTGCCTGGCTGGGAAGGTATTCGCCAACAAACAAATTAATAGGGATTTATTGGTGACACACCTACCGAATATCCTTCAAACAACTCAGCGGGTGGATATTGAGATTGTTGGATCTAATATTTTCGTGGCTCACTTCAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792251.1
MDPVEIQRLVDQLKLSEEADQATVPLTSKLTEQLRDKTKFCLAGKVFANKQINRDLLVTHLPNILQTTQRVDIEIVGSNIFVAHFKSIMDKKYALNGGPWHFFHDLLLFSEIEGFQNPSEVKFENFTGWIQCHNLPVACMHPEVIKRIGEQIGSVLEVDLGADGLCLGRFARVRVSWLLSRPLQRCIRLLPDGEMEEAIIILLYEKIPNFCFKCGKIGHLYRFCDESTMTTQEMKYGTWLMAPKTFVPSRKAAPNNQHTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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