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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005081`

染色体: Chr02 坐标: 72432735-72434269 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005081`
名称	SmilChr02G005081
描述	protodermal factor 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72432735 - 72434269 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009078`
GeneID	`131009078`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009078`
原始查询	`LOC131009078`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protodermal factor 1
产物	protodermal factor 1
Arabidopsis	`AT2G42840` (PDF1) protodermal factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818884] identity=52.2; qcov=0.57; evalue=1.5e-47; confidence=medium
Rice	`Os01g0726700` - identity=46.6; qcov=0.693; evalue=6.02e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27764 (PDF1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009078

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057792264.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057792264.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057792264.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792264.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792264.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72432993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:72433163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:72433167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:72433173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B13,B2,B41,B62
`Chr2:72433174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr2:72433194`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A11,A15,A18,A19,A20,A23,A3,B1,B103,B122,B123,B13,B130,B135,B139,B140,B2,B27,B32,B34,B35,B41,B55,B62,B68,B73,B75,B8,B86,B89,C10,C20,C29,C35,C39,C40,C54,C6,C64,C70,C77,C8,C82
`Chr2:72433196`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	44	A11,A15,A18,A19,A20,A23,A3,B1,B103,B122,B123,B13,B130,B135,B139,B140,B2,B27,B32,B34,B35,B41,B55,B62,B68,B73,B75,B8,B86,B89,C10,C18,C20,C29,C35,C39,C40,C54,C6,C64,C70,C77,C8,C82
`Chr2:72433199`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	44	A11,A15,A18,A19,A20,A23,A3,B1,B103,B122,B123,B13,B130,B135,B139,B140,B2,B27,B32,B34,B35,B41,B55,B62,B68,B73,B75,B8,B86,B89,C10,C18,C20,C29,C35,C39,C40,C54,C6,C64,C70,C77,C8,C82
`Chr2:72433483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B13,B2,B41,B62
`Chr2:72433560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:72433843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr2:72434088`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A7,B109,B136,B40,B64,B74,B80,B90,B92,B98,C40,C5,C78,C82,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792264.1

316 aa

158

316

PDF1_C

PF27764 PDF1_C 193-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792264.1`	Pfam	`PF27764`	PDF1_C	Domain	193	316	2.4e-51	173.7	Protodermal factor 1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936281.1
CAATATGCAGTAGTAGTGTGTGAAGAGTTAAATGAGAGTTTAAATGCGCAGTGCACCACAACTAACCCCCATACTTGCTTACCTGCTTCTATTTACTTCCCTCTCTCACTTCTCTTTAAATACATACTCATCTTCCCCCAACACCAACACTCTCTTCCTCCCTTCTCTCACCTCACCAAAATGGAGGCCTTGTTGCTGTGGACTGCTTTAGCTGCATTGCTATCCCAAAACTTTCTCCTTCCCGTCGTTTCCACTCCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009078
ATGGAGGCCTTGTTGCTGTGGACTGCTTTAGCTGCATTGCTATCCCAAAACTTTCTCCTTCCCGTCGTTTCCACTCCCACTTTCGTCGAAGACCAGAAGAATTACTACACCCCCGACCCCAACGCACAACCTCCTCCTGCAGTTACATACCCTCCTCCGTATAGCTCGGGAGGCGGCTCGCCACCCACGCACAGACCACCTTCCCACGGAGGCGGCGGCTCGACCCCCTCACACGGAGGCACGCCGCCATCCAACTGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792264.1
MEALLLWTALAALLSQNFLLPVVSTPTFVEDQKNYYTPDPNAQPPPAVTYPPPYSSGGGSPPTHRPPSHGGGGSTPSHGGTPPSNCGGSPPSGGHHHTSPPSGGGGYYNSPPSTPTPTPTTPYTPTPTPTTPYTPTPTPTTPYTPTPTPSTPTPTVRTPPTSPIDPGTPTTPTPGIAVPSPPFSFDPNSPPFTCTYWRNHPQLIWGLFGWLGTVGGAFGTGTGAGTGAGVGTGTPPIAGANMNLLEALSNTRTDGIGALY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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