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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002902`

染色体: Chr01 坐标: 47698916-47700022 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002902`
名称	SmilChr01G002902
描述	uncharacterized SmilChr01G002902
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47698916 - 47700022 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009081`
GeneID	`131009081`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009081`
原始查询	`LOC131009081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=33.1; qcov=0.451; evalue=1.13e-26; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=23.5; qcov=0.462; evalue=4.65e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009081

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792272.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792272.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057792272.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057792272.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057792272.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47699015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr1:47699242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:47699248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:47699302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C46
`Chr1:47699302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr1:47699318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:47699321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:47699327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,B88
`Chr1:47699355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:47699373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:47699376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:47699400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792272.1

368 aa

184

368

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 44-106 aa PF14392 zf-CCHC_4 183-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792272.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	44	106	1.3e-08	35.1	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057792272.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	183	210	1.8e-07	31.4	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936289.1
ATGCTTGCGGACCGCCCTTGCTTGACGCTTTCTTCGAGTTTCCGGCAAAGGCAGATCAAGACCTTTCAATTTTCTCTCCATGGTCGGATGTTTCTCAAAAAAGGGGAGGCGCCACGTTTTGCAGCGGATCTTTTCGCCGAGCTCTCCGCTGTTTGGAAACCCAACTCGGCTTGGGAGGTTATTCCTTTGGGAAAGGGTTACTTCACTCTGAAGTTCACTTCTCCAGAGGATTTTGCTGTGGCTTTTTCTAAGTCTGCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009081
ATGCTTGCGGACCGCCCTTGCTTGACGCTTTCTTCGAGTTTCCGGCAAAGGCAGATCAAGACCTTTCAATTTTCTCTCCATGGTCGGATGTTTCTCAAAAAAGGGGAGGCGCCACGTTTTGCAGCGGATCTTTTCGCCGAGCTCTCCGCTGTTTGGAAACCCAACTCGGCTTGGGAGGTTATTCCTTTGGGAAAGGGTTACTTCACTCTGAAGTTCACTTCTCCAGAGGATTTTGCTGTGGCTTTTTCTAAGTCTGCTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792272.1
MLADRPCLTLSSSFRQRQIKTFQFSLHGRMFLKKGEAPRFAADLFAELSAVWKPNSAWEVIPLGKGYFTLKFTSPEDFAVAFSKSAWRLRVGILFLQAWTPNFNPNKLESSTTQVWVRIFNLPHEFWHPEVLVGIAKHVGTPLLVDGLSARALVGYFARVLVEMNLALPIPDSIDVQCDEDIFEIEFKYEDLPSFCRLCSTLGHSTESCSSETDVGPSCPTQPAEQKGGRRGRRRRARSRRRRARSRTVVQALSLDPPED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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