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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005084`

染色体: Chr02 坐标: 72467051-72468400 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005084`
名称	SmilChr02G005084
描述	xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 24-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72467051 - 72468400 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009082`
GeneID	`131009082`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009082`
原始查询	`LOC131009082`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 24-like
产物	xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 24-like
Arabidopsis	`AT4G30270` (XTH24) xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 24 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829150] identity=59.7; qcov=0.869; evalue=5.86e-123; confidence=high
Rice	`Os06g0696400` (OsXTH11) - identity=58.2; qcov=0.912; evalue=4.62e-122; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005618 (cell wall); GO:0010411 (xyloglucan metabolic process); GO:0016762 (xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity); GO:0042546 (cell wall biogenesis); GO:0048046 (apoplast)
KEGG	-
Pfam	PF00722 (Glyco_hydro_16); PF06955 (XET_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009082

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057792269.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057792269.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057792269.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792269.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792269.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72467070`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A20,A4,A5,B106,B113,B114,B119,B127,B21,B26,B3,B31,B32,B38,B39,B63,B64,B72,B83,B85,B94,B95,B98,C13,C17,C24,C38,C4,C40,C59,C63,C75,C76,C77,C9,D1,D10,D3
`Chr2:72467073`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A8,B101,B131,B31,B35,B52,B6,B68,C14,C25,C36,C37,C48,C6,C8,C86,D4
`Chr2:72467100`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B137,B2,B37,B76,B87,C22,C47,C54,C74,D5
`Chr2:72467113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:72467123`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	81	A23,A24,A3,A6,B1,B10,B103,B104,B105,B108,B109,B11,B110,B112,B114,B118,B12,B123,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B135,B138,B14,B22,B23,B28,B32,B36,B41,B42,B43,B46,B47,B62,B64,B70,B73,B74,B78,B80,B82,B84,B87,B89,B90,B92,B93,B97,B98,C10,C15,C18,C2,C20,C22,C26,C29,C32,C4,C5,C54,C56,C58,C60,C62,C65,C68,C70,C74,C78,C79,C83,C87,C9,D3,D6,D8
`Chr2:72467191`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr2:72467191`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr2:72467193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:72467199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C64,C66
`Chr2:72467238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B12,C78
`Chr2:72467287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:72467348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792269.1

320 aa

160

320

Glyco_hydro_16

XET_C

PF00722 Glyco_hydro_16 60-240 aa PF06955 XET_C 272-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792269.1`	Pfam	`PF00722`	Glyco_hydro_16	Domain	60	240	9e-66	221.4	Glycosyl hydrolases family 16
`XP_057792269.1`	Pfam	`PF06955`	XET_C	Family	272	315	4.6e-20	71.9	Xyloglucan endo-transglycosylase (XET) C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936286.1
GATGTTTCCTTTTCGTCAACTCCAAAAAAATCTATATATACAAACCCTGCGAATGTTGCAGAGGCATCACAGCTCCACAATTCGAAGAAACAAGATGAAAATGGGAGTTTCCAGAAGTCACGGTCTGGTTTGGGTTTCAATGGCGTTGGTGGCGGCATTTGTGGTGCAGGGAAATTTCAACAGAGACGCGGACATCACTTGGGGCGACGGCCGCGCCAAAGTCGTCGACGGCGGCCGTGGCCTGAGCCTCTCCTTGGACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009082
ATGTTTCCTTTTCGTCAACTCCAAAAAAATCTATATATACAAACCCTGCGAATGTTGCAGAGGCATCACAGCTCCACAATTCGAAGAAACAAGATGAAAATGGGAGTTTCCAGAAGTCACGGTCTGGTTTGGGTTTCAATGGCGTTGGTGGCGGCATTTGTGGTGCAGGGAAATTTCAACAGAGACGCGGACATCACTTGGGGCGACGGCCGCGCCAAAGTCGTCGACGGCGGCCGTGGCCTGAGCCTCTCCTTGGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792269.1
MFPFRQLQKNLYIQTLRMLQRHHSSTIRRNKMKMGVSRSHGLVWVSMALVAAFVVQGNFNRDADITWGDGRAKVVDGGRGLSLSLDQYSGSGFQSKNFYLFGRFDMHMKLVPGNSAGTVTTFFLASEGPSHDEIDFEFLGNSTGEPYTVHTNVYSQGKGDKEQQFRLWFDPSAAFHKYTIVWNPSRIIFLVDEIPVRVFNNDGASGVPFPTSKPMRIICSLWSADDWATQGGRVKTDWSKAPFTAHYRNIKISGRPCAYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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