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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005091`

染色体: Chr02 坐标: 72501103-72503096 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005091`
名称	SmilChr02G005091
描述	receptor like protein 29
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72501103 - 72503096 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009088`
GeneID	`131009088`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009088`
原始查询	`LOC131009088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor like protein 29
产物	receptor like protein 29
Arabidopsis	`AT2G42800` (RLP29) receptor like protein 29 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818880] identity=59.9; qcov=0.961; evalue=2.42e-173; confidence=high
Rice	`Os05g0530701` - identity=54; qcov=0.884; evalue=8.01e-138; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009088

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057792276.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792276.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792276.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792276.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792276.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72501606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B68,C37,C8
`Chr2:72502565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B16,B25,B47,B85
`Chr2:72502726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr2:72502731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr2:72502835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792276.1

457 aa

228

457

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF00560 LRR_1 167-186 aa PF13855 LRR_8 167-226 aa PF00560 LRR_1 191-213 aa PF00560 LRR_1 216-237 aa PF13855 LRR_8 216-274 aa PF00560 LRR_1 240-261 aa PF00560 LRR_1 335-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792276.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	167	186	6.9e-29	94.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057792276.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	167	226	4.7e-24	84.6	Leucine rich repeat
`XP_057792276.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	191	213	6.9e-29	94.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057792276.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	216	237	6.9e-29	94.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057792276.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	216	274	4.7e-24	84.6	Leucine rich repeat
`XP_057792276.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	240	261	6.9e-29	94.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057792276.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	335	357	6.9e-29	94.4	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936293.1
GCCCCTTGGCTCCTTTCACTTCCATAGTTGAGTTTTTTTTTCTTTTAATTCCTCCATGCATTTCATTTTCTTTTCTTTTCCTCCTTTATTTGATGTTTGCCATTGTCATCATCATCAACTCTGATAAAATGTAACATGTCCTATTTTTCCCCTGCCCTTTTTCTCACTCATCCCTCATAGTAATTCTCAAGAAACATCACTTGGCCCTACCTTTTTGGCTTCAATTTTATCACTCAAGCTCTTGACCCCACCCATCATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009088
ATGCTCTCTTTATTCCCATTTCCCCTTCACCTCCTGCTGCTATTAATCTGTTTCCCAGTCTTCTCCACCAATCAGCAATCTCTAGCACCAGACAGCTCCATGAATCGCCACGAACTCGAAACCTTGTACAAGATCATGGAGAGCCTCTCGGCCGATGAGGACTGGCGAGCCGCCTACCCGAACCCCTGCCAGCCGGGTTCGGGCTGGACGGGGATCGAGTGCAAGCATTCGACACTCGACAACCTCCTCCACGTCACCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792276.1
MLSLFPFPLHLLLLLICFPVFSTNQQSLAPDSSMNRHELETLYKIMESLSADEDWRAAYPNPCQPGSGWTGIECKHSTLDNLLHVTRLDLGTFPNPACKNSATFPPEIFHLPNLDAVFIFQCFTNAPARISIPPNKLPPASPLQQLSLRSNSALIGTIPPQISTLKSLQILTLSQNRLTGPIPVEIFTSSSLLHLDLSYNTLTGTIPPEVGNLGKLVGLDLSYNKLTGAIPPTIGELRILQKLDLSSNLLTGTIPDSIHE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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