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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005094`

染色体: Chr02 坐标: 72516648-72521259 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005094`
名称	SmilChr02G005094
描述	citrate synthase, glyoxysomal-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72516648 - 72521259 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009090`
GeneID	`131009090`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009090`
原始查询	`LOC131009090`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	citrate synthase, glyoxysomal-like
产物	citrate synthase%2C glyoxysomal-like
Arabidopsis	`AT3G58750` (CSY2) citrate synthase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825044] identity=83.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0232400` - identity=81.8; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004108 (GO:0004108); GO:0005759 (mitochondrial matrix); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0006099 (tricarboxylic acid cycle)
KEGG	smil00020 (Citrate cycle (TCA cycle) - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00630 (Glyoxylate and dicarboxylate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00285 (Citrate_synt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009090

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792282.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057792282.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792282.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792282.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792282.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72516917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr2:72516994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:72517001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B98,D7
`Chr2:72517418`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C46
`Chr2:72517418`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C46
`Chr2:72517446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C11,C69
`Chr2:72517504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C54,C74,D11
`Chr2:72517939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C79
`Chr2:72519043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr2:72519045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:72519326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C74,D11
`Chr2:72519539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792282.1

509 aa

254

509

Citrate_synt

PF00285 Citrate_synt 96-465 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792282.1`	Pfam	`PF00285`	Citrate_synt	Domain	96	465	1.7e-134	449.1	Citrate synthase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936299.1
TATGTTGCTTTAGCGTATGGGAACACCTATCCAAACCAAGTTAGTTGTTTTCTATTTTTCTTCCTCTTTCCATAATTCCATCCATGCGTTGAAGCGCGAAGCCGCGAAGAGCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACAAGCGCGATCTGGTTATTGAAGCCTCTGTGTCGAACTGTTTGATTAAGAGCCAACAGCTCAAGGAAGAAATGGACGGTGTCGATCATTCAACACTTGCTCGAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009090
ATGGACGGTGTCGATCATTCAACACTTGCTCGAGGCCGCTTGGCGGTGCTCTCAGCTCACCTCTCAGCTTCATTTGATCAATCCGGCGCCGGAATTCTGGAATCCTCTGGCTGTTCCGCCGTCGTGGCACCGCCGCCGTATCTGAAGGGATCGTTAACTCTAATTGATGAGCGTACTGGCAACAAGTACCAGGTTCAGGTCTCCGAGGAAGGCACCGTCAAAGCCACCGACCTCAAAAAGATAACCACCGGAAAGAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792282.1
MDGVDHSTLARGRLAVLSAHLSASFDQSGAGILESSGCSAVVAPPPYLKGSLTLIDERTGNKYQVQVSEEGTVKATDLKKITTGKNDKGLKLYDPGYLNTAPVRSSICYIDGDEGILRYRGYPIEELAEGSSFLEVAYLLMYGNLPSEGQLADWEFSISQHSAVPQGVLDIIQAMPHDAHPMGVLVSAMSALSVFHPDANPALRGQDIYKSKQVRDKQIVRILGKAPTIAAAAYLRMAGRPPVLPSSNLSYSENFLYMLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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