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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005098`

染色体: Chr02 坐标: 72541437-72543748 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005098`
名称	SmilChr02G005098
描述	heat shock 22 kDa protein, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72541437 - 72543748 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009095`
GeneID	`131009095`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009095`
原始查询	`LOC131009095`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heat shock 22 kDa protein, chloroplastic-like
产物	heat shock 22 kDa protein%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G06460` (ACD32.1) alpha-crystallin domain 32.1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837158] identity=38.4; qcov=0.855; evalue=3.78e-44; confidence=medium
Rice	`Os01g0135800` (HSP16.6) - identity=37.8; qcov=0.374; evalue=1.51e-09; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0009408 (response to heat); GO:0009651 (response to salt stress); GO:0042542 (response to hydrogen peroxide); GO:0043621 (GO:0043621); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051259 (protein complex oligomerization)
KEGG	-
Pfam	PF00011 (HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009095

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792291.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792291.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792291.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792291.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72542144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr2:72542289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C8
`Chr2:72542323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C8
`Chr2:72542524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:72542626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C22
`Chr2:72542645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:72542700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr2:72542707`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C58,C81
`Chr2:72542707`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C58,C81
`Chr2:72542720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C81
`Chr2:72542723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:72542890`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792291.1

262 aa

131

262

HSP20

PF00011 HSP20 158-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792291.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	158	251	4e-15	56.5	Hsp20/alpha crystallin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096399.1
CAATGCTGCTTTTCTGTGCTCAAATTGTTGGTTCACAAAAAATCTACATTTCACATCACAATAGCAAAAATATCTCGACACCCTCATCTTAAATTGAGCAATTCCTTCAGCAGAACTTTGCAGTGTGGTTAGGTTGTCCAAAGTGTTTGTGGAATGGAGAGTCAAGCTGTGAGAAGAAGAGCGAATGTTATCGCAGCCCATCTAGCTTCTCATGAAGATATATCAGCCACTGCCACGCACGTTTTCCCCATGAGGTGTAG...

XM_057936308.1
AATGCTGCTTTTCTGTGCTCAAATTGTTGGTTCACAAAAAATCTACATTTCACATCACAATAGCAAAAATATCTCGACACCCTCATCTTAAATTGAGCAATTCCTTCAGCAGAACTTTGCAGTGTGGTTAGGTTGTCCAAAGTGTTTGTGGAATGGAGAGTCAAGCTGTGAGAAGAAGAGCGAATGTTATCGCAGCCCATCTAGCTTCTCATGAAGATATATCAGCCACTGCCACGCACGTTTTCCCCATGAGGTGTAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009095
ATGGAGAGTCAAGCTGTGAGAAGAAGAGCGAATGTTATCGCAGCCCATCTAGCTTCTCATGAAGATATATCAGCCACTGCCACGCACGTTTTCCCCATGAGGTGTAGCAACAGTCTGAACTCTGTTATCCGAAGATACGACAACAGGATGTACTTTGCTCGGCAAGGCTCAGATTCTCAAGGTTACCACATGAGACAGGCTATAAATGAACAGGGCAACTACGTGCAACCCAGCATGCCTTCGCAATCCACGGATTCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792291.1
MESQAVRRRANVIAAHLASHEDISATATHVFPMRCSNSLNSVIRRYDNRMYFARQGSDSQGYHMRQAINEQGNYVQPSMPSQSTDSGKKGSTSLDAPSYARPARVEPGLPPFKSIDASEGPVYARPTREEGKPVFNSMEKARNVAQTGSEWSPRMDVVESGFNYVITLEIPGVSNDNVKVEVDDQSLVISGNRLNRSCGALCSNKPIMTYHRREISRGPYRIVWPLPSNTMKDNVSAEIQDGLLRVTIPKLSGLRWLRKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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