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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005108`

染色体: Chr02 坐标: 72591050-72594964 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005108`
名称	SmilChr02G005108
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72591050 - 72594964 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009104`
GeneID	`131009104`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009104`
原始查询	`LOC131009104`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=31.8; qcov=0.972; evalue=2.56e-68; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=36; qcov=0.796; evalue=9.97e-80; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009104

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057792301.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792301.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792301.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792301.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792301.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72592540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A13,A5,B103,B114,B126,B127,B128,B14,B29,B31,B32,B37,B66,C14,C26,C39,C4,C41,C46,C48,C54,C60,C71,C74,C86,D10,D5
`Chr2:72592543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:72592546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr2:72592550`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B128
`Chr2:72592550`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B128
`Chr2:72592551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B117,B122,B137,B66,B98,C38
`Chr2:72593077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:72593132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B49,B72,C16,C46
`Chr2:72593141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr2:72593144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B9
`Chr2:72593177`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A14,A25,A3,A5,A8,B102,B124,B128,B129,B135,B18,B21,B39,B43,B51,B52,B8,B86,B94,C14,C27,C35,C52,C54,C63,C69,C7,C77,C80,D6
`Chr2:72593238`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	64	A10,A11,A14,A16,A20,A23,A24,A9,B105,B107,B114,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B131,B133,B19,B2,B20,B22,B25,B29,B32,B33,B35,B38,B39,B4,B44,B49,B50,B54,B65,B7,B71,B73,B81,B85,B86,B97,B99,C11,C15,C19,C25,C30,C35,C36,C43,C52,C57,C6,C62,C64,C67,C70,C78,C8,C85,D4,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792301.1

579 aa

290

579

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 151-318 aa PF23559 WHD_DRP 396-459 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792301.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	151	318	2.7e-45	154.8	NB-ARC domain
`XP_057792301.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	396	459	2.9e-15	56.8	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096401.1
TTTAAGTATCATTTATACCTTGTAGTAATATCATTAGAAAGCAGGTTTATTGTTGCACTTGCACTATACTACGTCAACGCGGGTGTATATTTGAGTTGGTCATCAGCATCTCCTCCTCTCCCTCAACGTTTCTTCCTCCTTCTCCCTAAGCCACCATCACTTGTTATCTCCCTCGTTTGATTTGCTCAAGCCTGTGAAACAAACCAATTTTCTTCAATCATGGCCTACGCTGCTCTCTCTTCACTAGCCCAAACAATACA...

XR_009096400.1
TTTAAGTATCATTTATACCTTGTAGTAATATCATTAGAAAGCAGGTTTATTGTTGCACTTGCACTATACTACGTCAACGCGGGTGTATATTTGAGTTGGTCATCAGCATCTCCTCCTCTCCCTCAACGTTTCTTCCTCCTTCTCCCTAAGCCACCATCACTTGTTATCTCCCTCGTTTGATTTGCTCAAGCCTGTGAAACAAACCAATTTTCTTCAATCATGGCCTACGCTGCTCTCTCTTCACTAGCCCAAACAATACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009104
ATGGCCTACGCTGCTCTCTCTTCACTAGCCCAAACAATACACCGAATCCTCAATCACGACCAATTCCTCATCTCCCACAATGAAGAACAACAAATCACCCTGCTACGTGAAAAAGTTATTTTCTTGCGAGAAGCTTTGGACAAGTTTCCAATGCAAGCCAGCAGCTTGGAAGCAAGAATCAGGGCCTCCGCCAACGAGGCAGAAGATATGATCGAGCATTTCATGTACGACCAAATATGGAATCATCATTATTCGACTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792301.1
MAYAALSSLAQTIHRILNHDQFLISHNEEQQITLLREKVIFLREALDKFPMQASSLEARIRASANEAEDMIEHFMYDQIWNHHYSTTNNPHHLHHDLEKTMEEINSISREAADFTTEDSAALGDDDSPTVRISSSMQQLAGGITVGLDEDLLKIVDSLTGGSSSRQIIPIVGMGGIGKTTLAQKVYHHPSITETFEIRAWVTVSQDYKAQNIYSDLLACFEEVGIERFEQSSECLEVKVHKILKGRKYLIVLDDMWSQNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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