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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005138`

染色体: Chr02 坐标: 72811791-72815721 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005138`
名称	SmilChr02G005138
描述	chaperone protein dnaJ C76, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72811791 - 72815721 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009133`
GeneID	`131009133`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009133`
原始查询	`LOC131009133`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ C76, chloroplastic
产物	chaperone protein dnaJ C76%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G42750` (AT2G42750) DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818875] identity=72.6; qcov=1.02; evalue=2.22e-170; confidence=high
Rice	`Os01g0730500` (OsDjC13) - identity=63.7; qcov=1.05; evalue=2.56e-145; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF13370 (Fer4_13); PF13459 (Fer4_15)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009133

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057792336.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057792336.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792336.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792336.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792336.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72812511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C44
`Chr2:72812537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr2:72812771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr2:72813417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:72813682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C8
`Chr2:72814113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:72814496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,D6
`Chr2:72815294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B9,C56,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792336.1

337 aa

168

337

DnaJ

Fer4_15

Fer4_13

PF00226 DnaJ 67-129 aa PF13459 Fer4_15 152-208 aa PF13370 Fer4_13 154-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792336.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	67	129	3.1e-18	66.4	DnaJ domain
`XP_057792336.1`	Pfam	`PF13459`	Fer4_15	Domain	152	208	1.4e-08	36.0	4Fe-4S single cluster domain
`XP_057792336.1`	Pfam	`PF13370`	Fer4_13	Domain	154	208	5.3e-15	56.6	4Fe-4S single cluster domain of Ferredoxin I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936353.1
CTTTCTTGTCCAGATTCACATTCACTCCAGATTCTTGTCCAAACATATGGCCTTCCTTCTGCCATCTCACCATTTCCCACTATTTCAATTTTCCTCTCCAAACTACCACTATTTTTTTCCTCCATTACATTCTACATACCGCCATACCGCCAAAATATCTCAAATTTTGATTAATTTCTTCTGGCCCCTCCTTTTTTTGCCTGCAGCTACTACTATTATACATTCTTTCTTGAAACGATTCTGAGATTCGGTAATGGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009133
ATGGCCCAGTTATTGCCGCCAGTTTGCACAGATACACTCAAATTTCATAACCCTTTAAGCAGTTTGTGCCCAAGAAACAGATGTCCCACAACAGGCAAGAATAATGTGAGATGGAGCAGCTATGGAGGAGGAAGGAAAGGGATTGGCAGAATCAGGGTTGCATCTCAGGAAGCTGCATCGTCCGAGGATGTTGCAGATGATTATTATGCTGTTTTGGGTCTGCTTCCAGATGCAACCCCGGAGCAAATAAAGAAAGCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792336.1
MAQLLPPVCTDTLKFHNPLSSLCPRNRCPTTGKNNVRWSSYGGGRKGIGRIRVASQEAASSEDVADDYYAVLGLLPDATPEQIKKAYYNCMKSCHPDLSGDDPETTNFCMFINEVYAILSDPVQRMVYDEIHGYALTAINPFFDDSSSKDHVFVDEFSCIGCKNCANVCSSVFAIEEDFGRARAYNQPGMLDSVQQAVESCPVDCIHWTSAAQLSLLEDEMRRVERVNVALMLSGMGSGAADVFRMASVRWEKRQAKVLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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