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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005180`

染色体: Chr02 坐标: 73088503-73092741 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005180`
名称	SmilChr02G005180
描述	transcription factor GTE4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73088503 - 73092741 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009171`
GeneID	`131009171`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009171`
原始查询	`LOC131009171`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor GTE4-like
产物	transcription factor GTE4-like
Arabidopsis	`AT1G06230` (GTE4) global transcription factor group E4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837133] identity=51.1; qcov=0.776; evalue=6.36e-122; confidence=high
Rice	`Os02g0250300` (GTE4) - identity=46.9; qcov=0.746; evalue=1.85e-96; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00439 (Bromodomain); PF17035 (BET)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009171

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792397.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792397.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792397.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792397.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792397.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73090536`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B112
`Chr2:73090536`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B112
`Chr2:73090608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:73090614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B140,C79,C8
`Chr2:73090901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B19,B25,B57,B62
`Chr2:73091042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B16,C18,C72
`Chr2:73091451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr2:73091596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:73091924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C73
`Chr2:73092118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:73092266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B140,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792397.1

575 aa

288

575

Bromodomain

BET

PF00439 Bromodomain 232-316 aa PF17035 BET 408-470 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792397.1`	Pfam	`PF00439`	Bromodomain	Domain	232	316	4.2e-18	65.8	Bromodomain
`XP_057792397.1`	Pfam	`PF17035`	BET	Domain	408	470	1.8e-23	83.1	Bromodomain extra-terminal - transcription regulation

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096409.1
TCTATGTAGAGTAAAGACAGATTGCAAAGAGGGGAAAAAATCTTCGAAAAGGTATGTGTTCGAAACCCTAATCTGAGCTCTACTGCTTGCGTGTGTATACGGCGGTGGCTGGTTGTGGTAGGAATAGAAGAAAGCTCTGTTTTAATTGAACTAGCCGTGGTGATTTAGTGCGTGTTCTGTCTCTGTGTTTCTCTCTCCATTGGCGGGATTATGTGAATTGAGTAGGGTTTGACTTCGCGTTGAAAAATTCAAGAAATTGA...

XR_009096410.1
TCTATGTAGAGTAAAGACAGATTGCAAAGAGGGGAAAAAATCTTCGAAAAGGTATGTGTTCGAAACCCTAATCTGAGCTCTACTGCTTGCGTGTGTATACGGCGGTGGCTGGTTGTGGTAGGAATAGAAGAAAGCTCTGTTTTAATTGAACTAGCCGTGGTGATTTAGTGCGTGTTCTGTCTCTGTGTTTCTCTCTCCATTGGCGGGATTATGTGAATTGAGTAGGGTTTGACTTCGCGTTGAAAAATTCAAGAAATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009171
ATGTTGGGGGGTGGGAATGAGGGATCTGAGGAGGATAAGCTGAGGGAGCGTAAGGTTTACAGTAGAAGGCCGTCGTTTAAAGGGCTTGAAAACAGTAACAGCAGTAGTAATTTGTTGAGGGAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCCGGAATCTCAGGCTATGGTTTCGGAGGGCTTGAATTCTATGAAGAGAATGCATAATTCTGGTGTTGATGCGGGCCGTGATGGCTTGGGTGGGAGGGGAGGGCTTCTGAGGCAGGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792397.1
MLGGGNEGSEEDKLRERKVYSRRPSFKGLENSNSSSNLLREQQQQQQPESQAMVSEGLNSMKRMHNSGVDAGRDGLGGRGGLLRQDKVRISLSMKSKRDALELRRKLESERDMVRSLMRRIESNEGIKNGAQGFDGRDGDKVAAGVGQPRMLKPLNPLSVLVNENSKPGNDVVEKEKRTPKANKFYRNTEFLLAKDKIPLGESNKKLKPNGKKGGGSGAGMESFPNHVLKSCTALLERLMKHKHAWVFNKPVDAVALGLH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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