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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005187`

染色体: Chr02 坐标: 73182662-73184352 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005187`
名称	SmilChr02G005187
描述	ervatamin-B-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73182662 - 73184352 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009180`
GeneID	`131009180`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009180`
原始查询	`LOC131009180`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ervatamin-B-like
产物	ervatamin-B-like
Arabidopsis	`AT1G06260` (AT1G06260) Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837137] identity=50.9; qcov=1.01; evalue=2.3e-124; confidence=high
Rice	`Os12g0273800` - identity=43.8; qcov=1.02; evalue=1.07e-102; confidence=medium
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0005764 (lysosome); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	-
Pfam	PF00112 (Peptidase_C1); PF08246 (Inhibitor_I29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009180

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057792409.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792409.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792409.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792409.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792409.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73182982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B34,C35,C67
`Chr2:73182996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:73182997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B114,C78,C79,C84
`Chr2:73183059`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C80
`Chr2:73183059`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C80
`Chr2:73183279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C67
`Chr2:73183620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C79
`Chr2:73183630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C40,C67
`Chr2:73183680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B32,D1
`Chr2:73183741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr2:73183820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr2:73183882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C79,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792409.1

346 aa

173

346

Inhibitor_I29

Peptidase_C1

PF08246 Inhibitor_I29 44-100 aa PF00112 Peptidase_C1 127-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792409.1`	Pfam	`PF08246`	Inhibitor_I29	Domain	44	100	6.5e-14	52.7	Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)
`XP_057792409.1`	Pfam	`PF00112`	Peptidase_C1	Domain	127	343	2.8e-79	267.0	Papain family cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936426.1
ACCAAATACAATAGGAAACTAAAAAACGATAGAGAACAGACAAGCTAACTGCATATGAAATTTAAACACGAAATATAGACAAAGGAGACACAACAAACTTGCCTTAGCAACAGAAAAAATAGGGCAATCAGACATGAACCAAACAGAATTCCCACCAATATAAGCATACTACACGACACAACACAACACCTATATTATGTGAGAGATCAGAAGCCAAACCTCGTAACAAAGTCTGCTTCCTCGAAATTCTTCTTGGGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009180
ATGAAGAGCACTTCATCTGTTACAAGAAACTATATGTTAGCAGCTATTGTGCTCGTGTGCATTCTTTGCGTTTCCTCGGATGCACGTCCAGAGAAGACGCCAAAGGAAGCAACAGTGGTGGAGAAGAGATACAAAAGCTGGCTGAAACAACACAACAAAGCGTACGAGAACAGGGAAGAATGGAACATGCGATTTGGAATCTACAAGTCTAATCTTAAGTTCATAGAATTCGTAAATGCGCAAAATCTTTCTTACAAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792409.1
MKSTSSVTRNYMLAAIVLVCILCVSSDARPEKTPKEATVVEKRYKSWLKQHNKAYENREEWNMRFGIYKSNLKFIEFVNAQNLSYKLTDNKFADMTNFEFQNTYLGYKSHRRPRKEQHNYAVDGYAVPSSRDWRKKGAVTAVKNQGSCGCCWAFSALGAVEGLNKIKTGKLVSLSPQELVDCNFDIDNQGCRGGFMEKAYEFMMLNGGISSESDYPYKGKQGICNPIIARKLAASITGYVQVPERNETAIQAAVARQPVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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