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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002985`

染色体: Chr01 坐标: 48783724-48784464 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002985`
名称	SmilChr01G002985
描述	transcription factor TCP2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48783724 - 48784464 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009207`
GeneID	`131009207`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009207`
原始查询	`LOC131009207`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TCP2-like
产物	transcription factor TCP2-like
Arabidopsis	`AT4G18390` (TCP2) TEOSINTE BRANCHED 1, cycloidea and PCF transcription factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827568] identity=52.2; qcov=0.856; evalue=2.07e-47; confidence=medium
Rice	`Os07g0152000` (OsTCP21) - identity=54.5; qcov=0.665; evalue=3.15e-34; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:2000032 (regulation of secondary shoot formation)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009207

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057792447.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792447.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057792447.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792447.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792447.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48783730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C59
`Chr1:48783732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D6
`Chr1:48783756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B114,B65
`Chr1:48783758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B5,C83
`Chr1:48783856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:48783868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B80,C6
`Chr1:48783874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:48783876`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr1:48783876`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr1:48783883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:48783884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:48783890`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B102,B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792447.1

215 aa

108

215

TCP

PF03634 TCP 44-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792447.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	44	190	2.4e-33	116.6	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936464.1
ATGACTCTGATCCCATGTGTCCACATTTATTCCAGACCCAACGCCACTGGCGGCGGCGTGCGCAACGGCGGCGTTGGCAGGTTCTATGGCTGGCCTTCCTCGCGAATTGTTAGGGTTTTGCGAGCATCCGGTGGGAAGGATAGGTATAGCAAGGTGTTGACATCGAAGGGGCTTCAAGACCGGCGGGTGAGGCTGTCGGTGAACACCGCCATCCAATTCTACGATCTGCAAGATCGATTGGGGTACGATCAACCAAGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009207
ATGACTCTGATCCCATGTGTCCACATTTATTCCAGACCCAACGCCACTGGCGGCGGCGTGCGCAACGGCGGCGTTGGCAGGTTCTATGGCTGGCCTTCCTCGCGAATTGTTAGGGTTTTGCGAGCATCCGGTGGGAAGGATAGGTATAGCAAGGTGTTGACATCGAAGGGGCTTCAAGACCGGCGGGTGAGGCTGTCGGTGAACACCGCCATCCAATTCTACGATCTGCAAGATCGATTGGGGTACGATCAACCAAGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792447.1
MTLIPCVHIYSRPNATGGGVRNGGVGRFYGWPSSRIVRVLRASGGKDRYSKVLTSKGLQDRRVRLSVNTAIQFYDLQDRLGYDQPSKAVEWLLKRAAASSIAELPPMNTSFLDTPKQLSDEKRPSTAGSDQLCYDSAEIELLPVAADDQIVGVQHTSETSNGLGLSLSRSDSRIKARERTKERVAEKEKENEPTHTXSLNPISHTTSFTELLNGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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