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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005217`

染色体: Chr02 坐标: 73380986-73384217 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005217`
名称	SmilChr02G005217
描述	probable transcription factor GLK1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73380986 - 73384217 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009248`
GeneID	`131009248`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009248`
原始查询	`LOC131009248`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable transcription factor GLK1
产物	probable transcription factor GLK1
Arabidopsis	`AT2G20570` (GPRI1) GBF's pro-rich region-interacting factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816579] identity=48.9; qcov=1.09; evalue=3.02e-95; confidence=high
Rice	`Os06g0348800` (OsGLK1) - identity=46.5; qcov=1.16; evalue=1.29e-88; confidence=high
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009248

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792502.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792502.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792502.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792502.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792502.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73381609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B117,C53,C81,D2
`Chr2:73381747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C58
`Chr2:73381779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B62
`Chr2:73381798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C55,C64,C66,D10
`Chr2:73382192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:73382205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr2:73382813`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A20,A22,A5,B108,B109,B114,B115,B117,B124,B125,B126,B127,B129,B135,B14,B17,B24,B25,B29,B30,B33,B52,B58,B62,B63,B66,B75,B78,B83,B88,B9,C20,C48,C6,C61,C63,C76,C77,C78,C84,D2
`Chr2:73382818`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	41	A20,A22,A5,B108,B109,B114,B115,B117,B124,B125,B126,B127,B129,B135,B14,B17,B24,B25,B29,B30,B33,B52,B58,B62,B63,B66,B75,B78,B83,B88,B9,C20,C48,C6,C61,C63,C76,C77,C78,C84,D2
`Chr2:73382937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B89
`Chr2:73382943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:73382978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:73382980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792502.1

413 aa

206

413

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 141-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792502.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	141	191	1.1e-08	35.8	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936519.1
GAGACAGGATGGAAGGGGTGCATTAATTATATAGCATATATATGTATAAAACCAAAAAAACAATAGCATAAAAACAAACTATGTGGAGAGGCCCCCTAACCAAATTGTGGTGGACATCATCTCCACCCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTTAAATTGGCAAAAAGTTGAACTCCCATCAGATTCATAAATCAGATAGATTTCCATTTTCTCATCAAGAAACATAAATTAAGTGCTGCACAACACAGATACACGTAGAGGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009248
ATGCTAGCTGTGTCGCCACTGAGAAACCCTAAGAATGAGAGAGAAGGCGAGATGGAAGGCTTCTCGATCGACGAGAGCGAGTTCGTCGATTTCGCGGGCGGGAATCTGCTCGACAGCATTGATTTCGACGATCTCTTCCTCGGCATCAGCGACGGCGACGTGCTGCCGGATCTGGAGATGGACCCTGAGCTCCTGGCCGAGTTTTCGGTTAGCGCGAGTGAGGAATCGGAGGTGAAAACGACGCCGCTCGACAAATCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792502.1
MLAVSPLRNPKNEREGEMEGFSIDESEFVDFAGGNLLDSIDFDDLFLGISDGDVLPDLEMDPELLAEFSVSASEESEVKTTPLDKSDDENTSEKQQQQHVIPAEEAAACGKDEMNPSPKEADRGRKSISHSKNSSGKRKVKVDWTPELHRRFVQAVEQLGVDKAVPSRILELMGIDCLTRHNIASHLQKYRSHRKHLLAREAEAASWSQRRQVYGGPAAAAGGKREHVNPWIAPTMGFPPVTPMPHFRPLHVWGHPSVDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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