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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005251`

染色体: Chr02 坐标: 73651175-73653213 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005251`
名称	SmilChr02G005251
描述	rhomboid-like protein 14, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73651175 - 73653213 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009266`
GeneID	`131009266`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009266`
原始查询	`LOC131009266`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhomboid-like protein 14, mitochondrial
产物	rhomboid-like protein 14%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G17611` (RBL14) RHOMBOID-like protein 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821028] identity=60.4; qcov=1.01; evalue=4.84e-132; confidence=high
Rice	`Os01g0283500` (OsRhmbd3) - identity=57.8; qcov=0.879; evalue=2.32e-98; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01694 (Rhomboid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009266

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057792536.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057792536.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057792536.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792536.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792536.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73651455`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A3,B101,B106,B121,B32,B39,B48,B55,B75,B78,B79,B80,B86,B92,C14,C2,C30,C31,C34,C39,C45,C48,C51,C56,C69,C74,D11,D7
`Chr2:73651538`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B35,C1,C65,C74
`Chr2:73651538`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B35,C1,C65,C74
`Chr2:73651543`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B35,C1,C65,C74
`Chr2:73651543`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B35,C1,C65,C74
`Chr2:73651601`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A10,A21,A3,B101,B106,B11,B12,B122,B134,B22,B35,B4,B49,B69,B7,B79,B8,B90,C1,C15,C2,C20,C3,C38,C47,C48,C51,C69,C71,C74,C78,D4
`Chr2:73651649`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A15,A18,A21,A3,B101,B106,B12,B122,B134,B21,B27,B32,B4,B47,B49,B55,B56,B69,B8,B93,B94,B96,C1,C15,C20,C29,C34,C38,C45,C48,C57,C64
`Chr2:73651659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,B96
`Chr2:73651687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr2:73651716`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A22,B11,B126,B47,B95,B96,C11,C32,C5,C78,C83,D2
`Chr2:73651717`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A22,B104,B20,B94,B96,C30
`Chr2:73651744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792536.1

323 aa

162

323

Rhomboid

PF01694 Rhomboid 71-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792536.1`	Pfam	`PF01694`	Rhomboid	Domain	71	216	3.1e-23	83.3	Rhomboid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936553.1
GATTATTGAGGAAAGTATTGAGAGATCTAGAACTTTCTGGGCGAACTTCCGTGCGAAGAAACTCGAGCTAAAATCTGGTATCGGATTCATAATTCATTCCACAATTCACAAATCTCGCCATTGTTGTAGCGAAAGAAAGAGGAGAAACTCCAATCAAATTCGGAGATGGATAGAGGAAGAAGAGGCGGAGGGATGGTAGGGCTGCTTCTGCTGCAGGCGCTGAGCGAGTATGGCCGCCTCGACCGCAAGCCTCCCGTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009266
ATGGATAGAGGAAGAAGAGGCGGAGGGATGGTAGGGCTGCTTCTGCTGCAGGCGCTGAGCGAGTATGGCCGCCTCGACCGCAAGCCTCCCGTCACGGCAGGCCTCATCGCCGCTAATACACTTATCTACCTGCGCCCTAAATTTCTCGATCCAATCCTCCCCACACTCAATCAAGTCTGGTTCAATCCGCACCTCATTGTCAAGAACAAGGATTTGAAGCGCTTTATTTTATCAGCATTCTACCACACTGGTGAACCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792536.1
MDRGRRGGGMVGLLLLQALSEYGRLDRKPPVTAGLIAANTLIYLRPKFLDPILPTLNQVWFNPHLIVKNKDLKRFILSAFYHTGEPHLVYNMLSLLWKGIQLENAMGSFEFASMVAALLGMSQGITLLLAKSLVLFDYEKAYYNEYAVGFSGVLFAMKVVLYSQSDSYTYVHGLMVPARYAAWAELVLIQMLVPGVSFLGHLGGILAGISYLYLTGARSCANPFVKIMRGAARLLGWPLRYVNGMFRPSSGRVFGRGTLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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