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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005280`

染色体: Chr02 坐标: 73845819-73847714 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005280`
名称	SmilChr02G005280
描述	uncharacterized SmilChr02G005280
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73845819 - 73847714 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009270`
GeneID	`131009270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009270`
原始查询	`LOC131009270`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF1365 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839892]; symbol=AT1G30130; hit=AT1G30130; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF1365 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839892]; symbol=AT1G30130; hit=AT1G30130; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G30130` (AT1G30130) DUF1365 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839892] identity=50; qcov=1; evalue=6.22e-110; confidence=high
Rice	`Os07g0153300` - identity=51.8; qcov=0.516; evalue=2.26e-55; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07103 (DUF1365)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057792538.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057792538.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057792538.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792538.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792538.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73846017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B94
`Chr2:73846026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B74
`Chr2:73846055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:73846066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B54
`Chr2:73846067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr2:73846074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C39
`Chr2:73846083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C83
`Chr2:73846092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C42
`Chr2:73846098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:73846101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B61,C5
`Chr2:73846107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B132,C57
`Chr2:73846135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C39,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792538.1

318 aa

159

318

DUF1365

PF07103 DUF1365 95-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792538.1`	Pfam	`PF07103`	DUF1365	Family	95	256	6.9e-35	121.5	Protein of unknown function (DUF1365)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936555.1
GAGACTATGAGTTTTCAAACATACACAACTAGCACAACTTACTAAAGTCAAAATGACTCCTCTATTTGTGCTAGGCTACATTATCTACACCACCATCACTTCCACCATACTATCACTCCTCCTCTTCCTCCGCCTCCTCCTCCGCCGCATCTCCTCCATACGAGCCTCGGAGGAGATCGGAAATGTCATCGCACTATACGAAGGCACCGTCTATCACGAGCGGCGCCACCCGGCCCGCAATGCCTTCCGTTTCCCGGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009270
ATGACTCCTCTATTTGTGCTAGGCTACATTATCTACACCACCATCACTTCCACCATACTATCACTCCTCCTCTTCCTCCGCCTCCTCCTCCGCCGCATCTCCTCCATACGAGCCTCGGAGGAGATCGGAAATGTCATCGCACTATACGAAGGCACCGTCTATCACGAGCGGCGCCACCCGGCCCGCAATGCCTTCCGTTTCCCGGCCCGTTACGCGCTCATCGACCTCGACCGCCCGCCCTACTCGCCTCCCAACTACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792538.1
MTPLFVLGYIIYTTITSTILSLLLFLRLLLRRISSIRASEEIGNVIALYEGTVYHERRHPARNAFRFPARYALIDLDRPPYSPPNYLSADDARRAAKTNGPVHLLMIPPSLGYERSPVNYYYCYEIEGSTKTLKKCLVEASNTPWGESVTFVFNPSSDLVPKSEYISPFMDMLGSWRLKVSEPGENLFAFIAVEHPHLGTYFRASFTATKVATPSPVSSDDLEAFFWLMPHRVSIMAYWNAVKLWWKNVTFFDHPRKENP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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