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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005327`

染色体: Chr02 坐标: 74126811-74128986 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005327`
名称	SmilChr02G005327
描述	universal stress protein PHOS34-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74126811 - 74128986 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009291`
GeneID	`131009291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009291`
原始查询	`LOC131009291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	universal stress protein PHOS34-like
产物	universal stress protein PHOS34-like
Arabidopsis	`AT1G11360` (AT1G11360) Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837678] identity=53; qcov=0.976; evalue=1.09e-77; confidence=high
Rice	`Os01g0783500` - identity=55.8; qcov=0.851; evalue=4.74e-64; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00582 (Usp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057792570.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792570.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792570.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792570.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792570.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74127106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:74127178`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr2:74127178`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr2:74127216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr2:74127249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C6
`Chr2:74127339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B34,C60,C77,D7
`Chr2:74127412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C6,C75
`Chr2:74127447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B58,B68,B76
`Chr2:74127522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C58
`Chr2:74127569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,B90,B92
`Chr2:74127627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C48,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792570.1

255 aa

128

255

Usp

PF00582 Usp 50-101 aa PF00582 Usp 122-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792570.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	50	101	1e-26	94.9	Universal stress protein family
`XP_057792570.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	122	220	1e-26	94.9	Universal stress protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936587.1
TTCTCTCCCAATCTCCCAAAACCGTTTTCCCCCAAATTCACAACCCCCAAAAAAAACCTAATCTCCGACGATCATGGCTTCGCCGCCGGCCACCGCCGCCAAACCCGCCGATCCGCCCAAAATCCACATCCAGCCCGTCCAGGTGAACACCTCCTCGCCGCGATTCCCCCCTCCGCCCGTCACCCCGAACTCCATCTACGCCGCCTCCTCCCCCTCCCTCCGCCGCATCGCGATCGCGGTGGACCTCAGCGACGAGAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009291
ATGGCTTCGCCGCCGGCCACCGCCGCCAAACCCGCCGATCCGCCCAAAATCCACATCCAGCCCGTCCAGGTGAACACCTCCTCGCCGCGATTCCCCCCTCCGCCCGTCACCCCGAACTCCATCTACGCCGCCTCCTCCCCCTCCCTCCGCCGCATCGCGATCGCGGTGGACCTCAGCGACGAGAGCGCCTTCGCGGTGAAGTGGGCGGCGGAGAACTACATCCGCCCCGGGGACACCGTGATCCTCCTCCACGTGCGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792570.1
MASPPATAAKPADPPKIHIQPVQVNTSSPRFPPPPVTPNSIYAASSPSLRRIAIAVDLSDESAFAVKWAAENYIRPGDTVILLHVRSTSVLYGADWGSSTPTTAGAGGGSSNPFTKSPPAPGAAASPRQMEEEYDQLTAKKASNLAQPLVEAHVPVKIHIVKDHDMKERLCLEVERLALSAVIMGSRGIGATARGRSKGKLGSVSDYCVQHCACPVVVVRYKQDDDDAAPGEKERERERGERDDEFHDANDQLTK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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