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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005281`

染色体: Chr02 坐标: 73855582-73856904 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005281`
名称	SmilChr02G005281
描述	transcription factor MYB30-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73855582 - 73856904 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009302`
GeneID	`131009302`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009302`
原始查询	`LOC131009302`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB30-like
产物	transcription factor MYB30-like
Arabidopsis	`AT3G23250` (MYB15) myb domain protein 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821904] identity=63.5; qcov=0.525; evalue=1.06e-47; confidence=medium
Rice	`Os10g0478300` (MYB110) - identity=62.6; qcov=0.525; evalue=8.49e-50; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009302

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792583.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792583.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792583.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792583.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792583.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73855701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B108,C78
`Chr2:73855727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B108,C78
`Chr2:73855776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B129
`Chr2:73855801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:73855850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr2:73855858`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A9,B74
`Chr2:73855858`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A9,B74
`Chr2:73855863`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A9,B74
`Chr2:73855863`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A9,B74
`Chr2:73855873`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A7,B53,B61,B93
`Chr2:73855873`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A7,B53,B61,B93
`Chr2:73855880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C50,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792583.1

219 aa

110

219

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-77 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792583.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	2.1e-28	98.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057792583.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	77	3.1e-17	63.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057792583.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	110	2.1e-28	98.9	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936600.1
CACGACAATTTATATCCCAAAATTACAGCTTCGCAGGTGATTTCGCATGCTGACAGCTTCTACTCCTTAAATCAAATACATATATAAATAGAAGTGAGCTTCTGCTTTGATATTAATTCTCGGAAATAAACAAAAATGGTGAGGGCTCCCACTTTTGACAGTAATGGAATTAAGAAGGGGGCATGGAGTAAAGAAGAAGACGACCGATTGAGAGCTCAAGTCGAGAGATTCGGCCACAACAACTGGCGCCGTCTGCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009302
ATGGTGAGGGCTCCCACTTTTGACAGTAATGGAATTAAGAAGGGGGCATGGAGTAAAGAAGAAGACGACCGATTGAGAGCTCAAGTCGAGAGATTCGGCCACAACAACTGGCGCCGTCTGCCCTCGTTAGCCGGGTTGGCTAGATGTGGGAAGAGCTGCAGATTGCGGTGGATGAACTATTTGAAGCCTGGCCTCAAACGAGGGAAATTCACCAAAATTGAAGAAGAACACATCATCAAATTACATGATCAACTCAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792583.1
MVRAPTFDSNGIKKGAWSKEEDDRLRAQVERFGHNNWRRLPSLAGLARCGKSCRLRWMNYLKPGLKRGKFTKIEEEHIIKLHDQLRNKWSAMAAKLHGRSDNEIKNYWHAHIKKRGRCHNDSDHHLHEERDEKNIDLYSFARDQDDVLAKPYGLFSPQINVDEFHDFGIFEEIQNDTSTLSNYSDIGSSFSSPSSTSAEFQGGFWFDPFEEDILEMELW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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