当前解析结果
SmilChr02G005203| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005203 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005203 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G005203 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 73287249 - 73289952 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009304 |
|---|---|
| GeneID | 131009304 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009304 |
| 原始查询 | LOC131009304 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0005634 (nucleus); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0036297 (interstrand cross-link repair); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009304 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057792585.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792585.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792585.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057792585.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057792585.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:73288509 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B70,C77 |
Chr2:73288537 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B43,B91,C56,C64 |
Chr2:73288551 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B59,B87,B96,C2,C79 |
Chr2:73288611 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B40,B75,B80 |
Chr2:73288625 |
G |
GGT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B87,C2 |
Chr2:73288625 |
G |
GGT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B87,C2 |
Chr2:73288636 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr2:73288640 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:73288690 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr2:73288722 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,B113 |
Chr2:73288724 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C55 |
Chr2:73288731 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,C25 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。