当前解析结果
SmilChr02G005200| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005200 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005200 |
| 描述 | protein DMP7 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 73264918 - 73265770 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009306 |
|---|---|
| GeneID | 131009306 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009306 |
| 原始查询 | LOC131009306 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein DMP7 |
| 产物 | protein DMP7 |
| Arabidopsis | AT4G28485 (DMP7)transmembrane protein, putative (DUF679 domain membrane protein 7) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828966] identity=53; qcov=1; evalue=1.01e-73; confidence=high |
| Rice | Os05g0562800- identity=51.7; qcov=1.04; evalue=5.34e-73; confidence=high |
| GO | GO:0010256 (endomembrane system organization) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF05078 (DUF679) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009306 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057792587.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.60000 | XP_057792587.1 |
| 3 | Vacuole | 液泡 | 0.60000 | XP_057792587.1 |
| 4 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.60000 | XP_057792587.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792587.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:73265436 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B103,B135,B70,C27,C74 |
Chr2:73265503 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B132,B74,C81 |
Chr2:73265551 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057792587.1PF05078
DUF679 32-194 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057792587.1 |
Pfam | PF05078 |
DUF679 | Family | 32 | 194 | 1.5e-65 | 220.8 | Protein of unknown function (DUF679) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。