当前解析结果
SmilChr02G005287| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005287 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005287 |
| 描述 | NDR1/HIN1-like protein 6 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 73892448 - 73893263 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009308 |
|---|---|
| GeneID | 131009308 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009308 |
| 原始查询 | LOC131009308 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | NDR1/HIN1-like protein 6 |
| 产物 | NDR1/HIN1-like protein 6 |
| Arabidopsis | AT1G65690 (AT1G65690)Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842880] identity=32.8; qcov=0.934; evalue=1.66e-28; confidence=low |
| Rice | Os08g0324200 (OsSTA209)- identity=43.8; qcov=0.827; evalue=2.35e-33; confidence=medium |
| GO | GO:0005886 (plasma membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009308 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057792589.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792589.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792589.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792589.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057792589.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:73892679 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B77,B84,D9 |
Chr2:73892797 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,B114,B4,C84 |
Chr2:73892824 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,A24,B136,D11 |
Chr2:73892833 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A5,B108,C78 |
Chr2:73892959 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B20,B7,B93 |
Chr2:73893007 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr2:73893049 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B77,D9 |
Chr2:73893138 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,B38,B39 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。