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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005318`

染色体: Chr02 坐标: 74055678-74059067 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005318`
名称	SmilChr02G005318
描述	lysine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74055678 - 74059067 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009310`
GeneID	`131009310`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009310`
原始查询	`LOC131009310`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	lysine--tRNA ligase%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G13490` (OVA5) Lysyl-tRNA synthetase, class II [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820551] identity=90.6; qcov=0.549; evalue=1.87e-64; confidence=medium
Rice	`Os02g0623500` - identity=89.6; qcov=0.549; evalue=3.84e-63; confidence=medium
GO	GO:0000049 (tRNA binding); GO:0004824 (lysine-tRNA ligase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005829 (cytosol); GO:0006430 (lysyl-tRNA aminoacylation)
KEGG	-
Pfam	PF00152 (tRNA-synt_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009310

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792590.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057792590.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792590.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792590.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792590.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74056794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:74057245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr2:74057305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B57,B92
`Chr2:74057305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B92
`Chr2:74057932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:74057948`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B132
`Chr2:74057948`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B132
`Chr2:74058098`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A13,A24,B19,B34,B44,B49,B58,B6,B64,B85,B94,C10,C43,C55,C75,C8,C81,D9
`Chr2:74058479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,C32,C68,C75
`Chr2:74058715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr2:74058716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792590.1

193 aa

193

tRNA-synt_2

PF00152 tRNA-synt_2 91-193 aa

XP_057792591.1

193 aa

193

tRNA-synt_2

PF00152 tRNA-synt_2 91-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792590.1`	Pfam	`PF00152`	tRNA-synt_2	Domain	91	193	2.4e-34	119.5	tRNA synthetases class II (D, K and N)
`XP_057792591.1`	Pfam	`PF00152`	tRNA-synt_2	Domain	91	193	2.4e-34	119.5	tRNA synthetases class II (D, K and N)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096421.1
ATGAAGAGAAGAAACGGGTCAAAAAGATGGGCTAGGGTTTTCCAGACTCCAGTCTTCGCGCGCCTCCACGATCTGCCGCGCCGCTTCCTTTTCAGACCGCCGTCCGTCTGTCCACTGGCAACTCACGCACACCGCACACGGTAAGCCCTCTCTTTCAGCTGGCCTGCAGCATCTACAGTCCTCGAACAATGCGGTTCCTCCAGCTCAGGATTTTGGATATTACAATGGAGGCGGTCAGGGTTCGAGAATGTACAAGAGTG...

XM_057936607.1
ATGAAGAGAAGAAACGGGTCAAAAAGATGGGCTAGGGTTTTCCAGACTCCAGTCTTCGCGCGCCTCCACGATCTGCCGCGCCGCTTCCTTTTCAGACCGCCGTCCGTCTGTCCACTGGCAACTCACGCACACCGCACACGGTAAGCCCTCTCTTTCAGCTGGCCTGCAGCATCTACAGTCCTCGAACAATGCGGTTCCTCCAGCTCAGGATTTTGGATATTACAATGGAGGCGGTCAGGGTTCGAGAATGTACAAGAGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009310
ATGGTCAATGACTCTGCTGACCTTCATTTCATATCAGCATTACGATCTTTCAACCACCGTGTGGTATATGCCAACGCAAACTATGACCATGTGGTGGGATGGAGAACTTCATCAATCCGCCGTCAAAACGAACTACCAAAGGAAAGTCTTCATGTGAATGATATGAAGTATCCTCACATCGTCCATGTAGAACAGGGAATAACTGAAGATGTAAACAATAAAGTATCCTCTGCTGTTGGAACACAGGTTATTGACTTGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792590.1
MVNDSADLHFISALRSFNHRVVYANANYDHVVGWRTSSIRRQNELPKESLHVNDMKYPHIVHVEQGITEDVNNKVSSAVGTQVIDLEDMIANPEVADVFRKRAKIISEIRKTVESAGFIEVETPVLQGAAGGAEARPFITYHNSLGQDMYLRIATELHLKRMLVGGFEKVYEIGRIFRNEGLSTRHNPEFTTI

XP_057792591.1
MVNDSADLHFISALRSFNHRVVYANANYDHVVGWRTSSIRRQNELPKESLHVNDMKYPHIVHVEQGITEDVNNKVSSAVGTQVIDLEDMIANPEVADVFRKRAKIISEIRKTVESAGFIEVETPVLQGAAGGAEARPFITYHNSLGQDMYLRIATELHLKRMLVGGFEKVYEIGRIFRNEGLSTRHNPEFTTI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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