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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005238`

染色体: Chr02 坐标: 73564808-73566603 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005238`
名称	SmilChr02G005238
描述	squamosa promoter-binding protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73564808 - 73566603 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009312`
GeneID	`131009312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009312`
原始查询	`LOC131009312`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	squamosa promoter-binding protein 1-like
产物	squamosa promoter-binding protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G53160` (SPL4) squamosa promoter binding protein-like 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841749] identity=49.7; qcov=0.81; evalue=9.37e-45; confidence=medium
Rice	`Os07g0505200` (GLW7) - identity=69; qcov=0.444; evalue=1.27e-36; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03110 (SBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792594.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792594.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792594.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792594.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792594.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73564997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B40,C40,C78,D10
`Chr2:73565081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:73565105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:73565255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:73566262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B45,C12
`Chr2:73566286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:73566321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:73566355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B80,C28,C38,C75
`Chr2:73566356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C14,C74
`Chr2:73566361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,B82,D5
`Chr2:73566436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792594.1

189 aa

189

SBP

PF03110 SBP 57-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792594.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	57	130	5.4e-32	110.6	SBP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936611.1
AGAAGAATGGAAAATTGTGGTCCTCAAGCATCTGACTCCATCTCTCCACTTTTCCTCTCAAAATTCCCATCACCCCACCACCCAATATCTCCTCATTTGATCACTACTATACTACTACTACTATATATTTATTTTTCCATAACACATGATGATGAATGAGGGCAAGCCCATGAAGGGGAAGATGATGAAGAGGGATTGCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGACTCCGACGACGATGAACTCACGCCAGAGGACGACAAGCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009312
ATGATGATGAATGAGGGCAAGCCCATGAAGGGGAAGATGATGAAGAGGGATTGCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGACTCCGACGACGATGAACTCACGCCAGAGGACGACAAGCGGAAGAGGGTGGCCGGCGCCAAGAAAGGAGGCGGTGGCGGCGGCGACATGAAGAGCTGCCAGGCGGAGAAGTGCTCCGCTGATCTCGCCGCCGCCAAGGCCTACCACCGCCGCCATAAGGTCTGCGAGCACCACGCCAAGGCGCAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792594.1
MMMNEGKPMKGKMMKRDCAAAAAADSDDDELTPEDDKRKRVAGAKKGGGGGGDMKSCQAEKCSADLAAAKAYHRRHKVCEHHAKAQVAVVAGIRQRFCQQCSRFHELSEFDDAKRSCRRRLAGHNERRRKNPGDGSQAEGSTSGRIKGGGGTTAGGHQLKEMVCGQVDDRGRIQMTVQENSTYKHFHVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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