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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005213`

染色体: Chr02 坐标: 73339427-73341167 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005213`
名称	SmilChr02G005213
描述	60S ribosomal protein L23a-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73339427 - 73341167 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009315`
GeneID	`131009315`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009315`
原始查询	`LOC131009315`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L23a-like
产物	60S ribosomal protein L23a-like
Arabidopsis	`AT3G55280` (RPL23AB) ribosomal protein L23AB [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824694] identity=86.5; qcov=0.912; evalue=9.11e-71; confidence=high
Rice	`Os01g0348700` (OsRPL23A) - identity=79.5; qcov=0.918; evalue=1.42e-68; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0019843 (rRNA binding); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00276 (Ribosomal_L23); PF03939 (Ribosomal_L23eN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009315

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792597.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057792597.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792597.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792597.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792597.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73340187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B68,B75,B80
`Chr2:73340189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B100
`Chr2:73340189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:73340213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B11,B111,C10,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792597.1

170 aa

170

Ribosomal_L23eN

Ribosomal_L23

PF03939 Ribosomal_L23eN 29-79 aa PF00276 Ribosomal_L23 89-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792597.1`	Pfam	`PF03939`	Ribosomal_L23eN	Family	29	79	1.3e-18	67.5	Ribosomal protein L23, N-terminal domain
`XP_057792597.1`	Pfam	`PF00276`	Ribosomal_L23	Family	89	150	1.7e-13	51.4	Ribosomal protein L23

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936614.1
ATAACTCATGTCTGTATTGAGTTATAGCTATTGGGTTATCTAATTTATATGTTTGTACAGGTAAAAGTTGCATTAGGGCTACTTCCGTTTCAAATGGCTCCAGCTAAAGGTGATGCAGGTAAGAAGTCAGACGCCAAGGCTCAAGCCTTAAAGGCGGCCAAGGCTGTAAAAGCAGGTGCAACAACCTTTAAGAAAAAGGCCAAGAAAATACGCACTAAAGTTACCTTCTATCGGCCGAAGACATTGACAAAGGAAAGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009315
ATGTTTGTACAGGTAAAAGTTGCATTAGGGCTACTTCCGTTTCAAATGGCTCCAGCTAAAGGTGATGCAGGTAAGAAGTCAGACGCCAAGGCTCAAGCCTTAAAGGCGGCCAAGGCTGTAAAAGCAGGTGCAACAACCTTTAAGAAAAAGGCCAAGAAAATACGCACTAAAGTTACCTTCTATCGGCCGAAGACATTGACAAAGGAAAGGAATCCCAAGTATCCTCGCATTAGTGTTGTTCCTCGCAACAAACTTGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792597.1
MFVQVKVALGLLPFQMAPAKGDAGKKSDAKAQALKAAKAVKAGATTFKKKAKKIRTKVTFYRPKTLTKERNPKYPRISVVPRNKLDHYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKAAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIGII

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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