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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005339`

染色体: Chr02 坐标: 74240371-74242892 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005339`
名称	SmilChr02G005339
描述	protein VASCULATURE COMPLEXITY AND CONNECTIVITY
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74240371 - 74242892 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009318`
GeneID	`131009318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009318`
原始查询	`LOC131009318`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein VASCULATURE COMPLEXITY AND CONNECTIVITY
产物	protein VASCULATURE COMPLEXITY AND CONNECTIVITY
Arabidopsis	`AT2G32280` (AT2G32280) GPI inositol-deacylase C, putative (DUF1218) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817788] identity=64.3; qcov=0.994; evalue=3.04e-73; confidence=high
Rice	`Os07g0545100` - identity=45.9; qcov=0.994; evalue=5.84e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06749 (DUF1218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057792600.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057792600.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057792600.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792600.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792600.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74240983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:74242503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B17
`Chr2:74242521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C79
`Chr2:74242613`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A10,A18,B39,B41,B72,B76,C26,C5,C51,C59,C8,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792600.1

158 aa

158

DUF1218

PF06749 DUF1218 58-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792600.1`	Pfam	`PF06749`	DUF1218	Family	58	145	1.1e-20	74.6	Protein of unknown function (DUF1218)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936617.1
TGCAGAGAATAACTTTAGCAAAGAATAGATGCTCAAAACTAAACACACCTTTTCTTCTTCCCATTTGAAAAGAATCCCAAGGGCTCGAAGCAAAGAATATCAAAACCATTTAACTACAAAAAAGTACTATCAAGAAATAAAGTCACCACTATCACTATGTTGACAAAAGAGGCTTTTTCAAAACACATCCACACACACTAACATATCTACCTACATTCACTCCTTTAATCCCCTCTCCAAAGCTTCTTCACCATCACTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009318
ATGGGGAAATTCATCGGCATTTTCGCCTGCCTCTTGATCGTTGCACTCGACGTCGTTGGTGGGATTCTTGGGATCAAAGCAGAAGCAGCTCAAAACCAGGAGAAGCATTTGAGGCTGTGGATATTTGAGTGCAAGGAGCCAAGCCATGATGCATATATATTAGGGTTAGCAGCAGCAAGTCTTCTTGGAATAGCTCATGTTTTGGCTAACTTGCTTGGAGGCTGCAGTGTTTGCACTCAAGAAGAGATTGAGAAAGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792600.1
MGKFIGIFACLLIVALDVVGGILGIKAEAAQNQEKHLRLWIFECKEPSHDAYILGLAAASLLGIAHVLANLLGGCSVCTQEEIEKASPTKQLSIACLIFTWIILAVGLSMLVIGIISNHKSRASCGFTHHHFLSIGGILCMVHALFAVAYYVTATSNT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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