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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005294`

染色体: Chr02 坐标: 73922742-73924169 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005294`
名称	SmilChr02G005294
描述	lysM domain-containing protein ARB_03442-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73922742 - 73924169 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009331`
GeneID	`131009331`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009331`
原始查询	`LOC131009331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysM domain-containing protein ARB_03442-like
产物	lysM domain-containing protein ARB_03442-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0783000` (AM3) - identity=58.8; qcov=0.537; evalue=1.04e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01476 (LysM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009331

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057792619.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792619.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792619.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792619.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792619.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73924028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B12,B124,B7
`Chr2:73924115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:73924120`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A6,B22,B68,C24
`Chr2:73924120`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A6,B22,B68,C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792619.1

96 aa

LysM

PF01476 LysM 54-92 aa

XP_057792620.1

95 aa

LysM

PF01476 LysM 53-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792619.1`	Pfam	`PF01476`	LysM	Domain	54	92	2.4e-10	40.9	LysM domain
`XP_057792620.1`	Pfam	`PF01476`	LysM	Domain	53	91	1.9e-10	41.2	LysM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936637.1
ATCTCAAATAAAATTCATTTGAGAAAGAGAGATTAAATATTAATCACAATGGCTCATCAGACTAACAACGCATTCTTCTTCAAATTGGCTCTTGTGCTTAGTCTAGTTCTTATGATGTCTATAGCTGAGAGTGTTAATCTTCGCGTTGGATTTAAAAAGCAAGACGCAGCTGATGCAGTTTGCAACTCAGTGCATGGAACTGAGAGTGACGAGACATGTTCAAGCGTGGCTCAAGAATTCAATCTCTCTTTGGATGAATT...

XM_057936636.1
ATCTCAAATAAAATTCATTTGAGAAAGAGAGATTAAATATTAATCACAATGGCTCATCAGACTAACAACGCATTCTTCTTCAAATTGGCTCTTGTGCTTAGTCTAGTTCTTATGATGTCTATAGCTGAGAGTGTTAATCTTCGCGCAGTTGGATTTAAAAAGCAAGACGCAGCTGATGCAGTTTGCAACTCAGTGCATGGAACTGAGAGTGACGAGACATGTTCAAGCGTGGCTCAAGAATTCAATCTCTCTTTGGATGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009331
ATGGCTCATCAGACTAACAACGCATTCTTCTTCAAATTGGCTCTTGTGCTTAGTCTAGTTCTTATGATGTCTATAGCTGAGAGTGTTAATCTTCGCGTTGGATTTAAAAAGCAAGACGCAGCTGATGCAGTTTGCAACTCAGTGCATGGAACTGAGAGTGACGAGACATGTTCAAGCGTGGCTCAAGAATTCAATCTCTCTTTGGATGAATTTCTCGCAATTAATCCCAATATTAACTGCGACTCAGTCTTTGTGGGTCA...

LOC131009331
ATGGCTCATCAGACTAACAACGCATTCTTCTTCAAATTGGCTCTTGTGCTTAGTCTAGTTCTTATGATGTCTATAGCTGAGAGTGTTAATCTTCGCGCAGTTGGATTTAAAAAGCAAGACGCAGCTGATGCAGTTTGCAACTCAGTGCATGGAACTGAGAGTGACGAGACATGTTCAAGCGTGGCTCAAGAATTCAATCTCTCTTTGGATGAATTTCTCGCAATTAATCCCAATATTAACTGCGACTCAGTCTTTGTGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792619.1
MAHQTNNAFFFKLALVLSLVLMMSIAESVNLRAVGFKKQDAADAVCNSVHGTESDETCSSVAQEFNLSLDEFLAINPNINCDSVFVGQRLCVDGSA

XP_057792620.1
MAHQTNNAFFFKLALVLSLVLMMSIAESVNLRVGFKKQDAADAVCNSVHGTESDETCSSVAQEFNLSLDEFLAINPNINCDSVFVGQRLCVDGSA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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