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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005360`

染色体: Chr02 坐标: 74319063-74320542 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005360`
名称	SmilChr02G005360
描述	MYB-like transcription factor ETC3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74319063 - 74320542 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009333`
GeneID	`131009333`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009333`
原始查询	`LOC131009333`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MYB-like transcription factor ETC3
产物	MYB-like transcription factor ETC3
Arabidopsis	`AT2G46410` (CPC) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819249] identity=58.3; qcov=0.645; evalue=1.44e-18; confidence=low
Rice	`Os01g0619100` (OsTCL1) - identity=60; qcov=0.484; evalue=6.11e-18; confidence=low
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0030154 (cell differentiation)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009333

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792622.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792622.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792622.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792622.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74319324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr2:74319365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr2:74319798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr2:74320271`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	102	A10,A4,A7,A9,B10,B101,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B12,B120,B122,B131,B132,B135,B140,B2,B21,B3,B30,B31,B33,B36,B38,B39,B40,B42,B43,B45,B48,B49,B50,B53,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B74,B78,B82,B95,B97,B98,B99,C11,C13,C15,C17,C18,C19,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C4,C42,C45,C48,C50,C51,C54,C55,C57,C58,C6,C60,C62,C64,C65,C68,C69,C70,C75,C78,C79,C8,C80,C81,C82,D10,D11,D4,D5,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792622.1

93 aa

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 42-84 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 44-86 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792622.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	42	84	4.4e-11	43.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057792622.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	44	86	6.1e-05	23.8	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936639.1
ATTCCCATTTTAATCAACTACCCTTCTCCCTTATCCCTTGCCTTTTCTGTTCTTCTATTCAACTACCCTTTAAATTCTCCCAAAAAGCAGATCAGACATTCTGTTTTTATCCTAGATGTTTTGCAAGAATTTTGCACAACACATCCACAGACACTAATATTCACACACACTCACACACTACACACACGATATTTTCCATAAATATCCAAAAATATTGTCATCGTCTTCGAAATATCTCCAGAAACCCTAATTATGGCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009333
ATGGCTGATGATCCGATGCAGAAGGCCGAAGCCTCCGACGATGCCGCGTCGATAAGCTCCAGAGGGGAAGTATTAGATTTGGTAGCAGCTGATGAAAATCACAGCAGTGAAGAAGCCAAGAAGCTTGAGTTTTCTGAAGATGAGGAAACCCTAATAATTAGGATGTACAATTTGGTTGGAGACAGGTGGTCTCTGATAGCCGGAAGAATTCCTGGAAGAAGTGCTGAGGAAATTGAGAAGTACTGGAATTCCAGACATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792622.1
MADDPMQKAEASDDAASISSRGEVLDLVAADENHSSEEAKKLEFSEDEETLIIRMYNLVGDRWSLIAGRIPGRSAEEIEKYWNSRHSTDQTTD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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