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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003075`

染色体: Chr01 坐标: 49592259-49597744 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003075`
名称	SmilChr01G003075
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49592259 - 49597744 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009335`
GeneID	`131009335`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009335`
原始查询	`LOC131009335`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=28.8; qcov=0.651; evalue=1.01e-62; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=29.8; qcov=0.633; evalue=6.89e-67; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF07727 (RVT_2); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009335

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792624.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792624.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792624.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792624.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792624.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49592561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr1:49592571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B105
`Chr1:49592571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:49592621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:49592667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr1:49592961`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D6
`Chr1:49592961`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D6
`Chr1:49595371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B60,B94
`Chr1:49595384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B60
`Chr1:49595384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:49595570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:49595614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792624.1

1104 aa

552

1104

RVT_2

NB-ARC

WHD_DRP

PF07727 RVT_2 1-161 aa PF00931 NB-ARC 365-532 aa PF23559 WHD_DRP 618-689 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792624.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	1	161	2.1e-46	159.3	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057792624.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	365	532	1.9e-40	139.0	NB-ARC domain
`XP_057792624.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	618	689	8.5e-16	58.5	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936641.1
ATTCACCAAATGGATGTGAAAACTGCGTTCTTGTATGGCGAGTTGGAAGATGAAATATATATGAAGCAACCTGAAGGGTTTGTAGTACCTGGGCAAGAGCACAAAGTATGCAAACTTCAAAGGTCTTTATATGGGTTGAAGCAAGCACCGCTTCAATGGCATTTAAAATTTGACAGTGTAATGTTGTCAAATGGATTCAGAATCAATGAGTGCGATAAATGTGTCTACATTAAGAATTCTAATAACGGATATGTTATTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009335
ATGGATGTGAAAACTGCGTTCTTGTATGGCGAGTTGGAAGATGAAATATATATGAAGCAACCTGAAGGGTTTGTAGTACCTGGGCAAGAGCACAAAGTATGCAAACTTCAAAGGTCTTTATATGGGTTGAAGCAAGCACCGCTTCAATGGCATTTAAAATTTGACAGTGTAATGTTGTCAAATGGATTCAGAATCAATGAGTGCGATAAATGTGTCTACATTAAGAATTCTAATAACGGATATGTTATTGTTTGTCTTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792624.1
MDVKTAFLYGELEDEIYMKQPEGFVVPGQEHKVCKLQRSLYGLKQAPLQWHLKFDSVMLSNGFRINECDKCVYIKNSNNGYVIVCLYVDDMLIMGSNFRVIQETKGMLSKNFSMKDMGLADVILGIKILRRPDGITITQSHYVEKVLKKFNAFDKPIAKTPWEPSVHLSVHKGEPVDAIEYAKIIGSLLYLTNCTRPDIACSVNKLGSFTANPSNEHWKSLERVLRYLKYTQNYAIHYTREPSVLEGYCDANWISDAKDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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