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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005388`

染色体: Chr02 坐标: 74518290-74520773 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005388`
名称	SmilChr02G005388
描述	uncharacterized SmilChr02G005388
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74518290 - 74520773 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009366`
GeneID	`131009366`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009366`
原始查询	`LOC131009366`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09140; symbol=AT3G09140; hit=AT3G09140; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09140; symbol=AT3G09140; hit=AT3G09140; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09140` (AT3G09140) - identity=29.4; qcov=1.06; evalue=8.43e-49; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=31.2; qcov=0.753; evalue=6.67e-42; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009366

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792644.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792644.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792644.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792644.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792644.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74518377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B3,B50
`Chr2:74518639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C78
`Chr2:74518656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B31,B79,C81
`Chr2:74518662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B124,C45
`Chr2:74518671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr2:74518693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B61,B98,C41,C61
`Chr2:74518711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr2:74518788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:74518864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,B98
`Chr2:74518930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:74518974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr2:74518987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B125,B138,B31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792644.1

477 aa

238

477

DUF674

PF05056 DUF674 8-432 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792644.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	8	432	7e-98	329.1	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936661.1
CTACCTTCTACTGCGTGTTTGCCGAATCTCATGTTCCACGCCTTCCTATTGTCATCAAAATCCTCCTTCGTCCCACAATCTCGCCACTCAAACACGATTTTCTTGCTTCAGTCGCTGAAAATCCCCAATTCATTGTGATTAGGATGTCTGATTCCAAGAAAGATGTTACGTTCTCGTTGAAAGCTATGGTGAATGAAGAGAAAAGGAAGGTTCTATTCGCAGATGTCGACAGCACCTTTGCAGATGTGTTGTTGAGCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009366
ATGTCTGATTCCAAGAAAGATGTTACGTTCTCGTTGAAAGCTATGGTGAATGAAGAGAAAAGGAAGGTTCTATTCGCAGATGTCGACAGCACCTTTGCAGATGTGTTGTTGAGCTTCCTCACATTGCCATTGGGAACGATCGTGAGAATCTTGAAGAAGCACTATGAAGATGAACAGCCTGTGTTTGGAAGCTTAACCACTTTATACAATGGTTTAGAAAATCTTGATAGTGTCCATTTTTGGACAAAAGGTGCTAAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792644.1
MSDSKKDVTFSLKAMVNEEKRKVLFADVDSTFADVLLSFLTLPLGTIVRILKKHYEDEQPVFGSLTTLYNGLENLDSVHFWTKGAKSILLHPQSSSDDQRKRLKLDVSDSPPAEYFVCEKDCDESTSFDGESMYHDNVIACKYSKSHSTKRKVAGIQTTPCDDGVFTINTASFVVTDDLCIVPTSSGLLQIVSFLGITDMDKAKQVNVTFGYAEVIALLKASLMSSTPLSDVIFSKTGQVKSTALKLQHMTLSDQIGNAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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