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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005407`

染色体: Chr02 坐标: 74584570-74636751 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005407`
名称	SmilChr02G005407
描述	uncharacterized SmilChr02G005407
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74584570 - 74636751 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009378`
GeneID	`131009378`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009378`
原始查询	`LOC131009378`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09110; symbol=AT3G09110; hit=AT3G09110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=33.6; qcov=0.705; evalue=4.49e-47; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=29.6; qcov=0.78; evalue=1.18e-36; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009378

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792668.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792668.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792668.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792668.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792668.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74634031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C43,C56,C9
`Chr2:74634039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,C9
`Chr2:74634092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B119,C43,C52,C78
`Chr2:74634283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:74634405`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A18,A6,B16,B53,B64,B67,C20,C53,C71
`Chr2:74634407`	`A`	`AC`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	8	B58,B63,B69,C2,C38,C50,C68,C84
`Chr2:74634508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B53,B64,C20,C71
`Chr2:74634723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B3
`Chr2:74634815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B124,B7,B71,C45
`Chr2:74635462`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B26,C15,C57
`Chr2:74635462`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B26,C15,C57
`Chr2:74635465`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B26,C15,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792668.1

464 aa

232

464

DUF674

PF05056 DUF674 6-427 aa PF05056 DUF674 379-459 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792668.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	6	427	5.1e-101	339.4	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057792668.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	379	459	5.1e-101	339.4	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936685.1
ATATTTTACTCTTTTCTATTGACAAAACTTTACTGTTTGCTCCATTTTGCTTTAGTAGCCAAATAATGTAAGTGCTTCTCTCTCACTCCTCTCTTCACTTTTAGCAGCTCATAACCACCGCCGCAGCCACCCTTCCTCCGCCGCGCGCTCAACCACCCCCATCCAACAACACTTTTTCTTCTGGTTTAGACTTGAAGATCAGTATTCTGAAAATCCCCAATTTTTATAAATTGGAAGTCAGAGCACTCCAAAATGTCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009378
ATGTCTGATGCTAAAGAAGTAGAGTTCTCACTGAAAGTGATGATAAATAAAGAGAAAACTAAGGTACTCTTTGCAGAAGTTGATAGCCATTTTGCAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGACATTGCCGTTGGGAAGAATTATGAAAATCCTCGAGAAGCACTATGGCGATGAAGCACCTACCATTGGAAGCTTAAACACTTTGTACCATAGCTTAGCCAATCTTGATAATGCCTATTTCTGGACAGATGGTGCTAAGCAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792668.1
MSDAKEVEFSLKVMINKEKTKVLFAEVDSHFADILLSFLTLPLGRIMKILEKHYGDEAPTIGSLNTLYHSLANLDNAYFWTDGAKQTFLNPASSFEAEYERLKLDITDYQPARYFVCTYGHRFRSVSMYYDSIKKCTKCHRDVFGEEVAEKGPQTASRDGVFTIHTTSFIISDDLQILPNETGILGIFSILGISDMDKAEPINVTFGFSEIMSLLKGCFISTTPFSDLILNKTRQANSVTVEPEAETSSLNQIENEHNPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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