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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005431`

染色体: Chr02 坐标: 74737112-74739828 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005431`
名称	SmilChr02G005431
描述	uncharacterized SmilChr02G005431
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74737112 - 74739828 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009392`
GeneID	`131009392`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009392`
原始查询	`LOC131009392`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01130` (AT5G01130) - identity=25.3; qcov=1.14; evalue=3.34e-35; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=27.2; qcov=0.878; evalue=9.79e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009392

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792678.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792678.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792678.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792678.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792678.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74737257`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A14,B118,B60,B84,C10,C12,C35,C44,C86,D9
`Chr2:74737260`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A14,B118,B60,B84,C10,C12,C35,C44,C86,D9
`Chr2:74737950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:74737955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr2:74738053`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	104	A11,A14,A15,A16,A18,A2,A21,A22,A23,A24,A25,A7,A8,B100,B105,B118,B121,B123,B13,B133,B135,B139,B14,B15,B2,B20,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B34,B35,B36,B37,B42,B43,B44,B46,B49,B5,B52,B54,B56,B61,B62,B64,B66,B68,B70,B71,B74,B79,B8,B84,B90,B92,B96,B98,C12,C15,C16,C17,C18,C19,C21,C27,C29,C30,C32,C33,C34,C39,C40,C42,C45,C48,C49,C55,C57,C59,C6,C61,C68,C7,C70,C73,C75,C77,C8,C80,C83,C85,C86,C9,D1,D10,D2,D3,D5,D7,D9
`Chr2:74738056`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	93	A18,A19,A2,A20,A21,A22,A3,A4,A5,A6,A7,B101,B102,B104,B11,B111,B115,B120,B121,B126,B129,B13,B137,B139,B14,B140,B15,B20,B23,B28,B3,B33,B35,B36,B4,B44,B45,B46,B51,B52,B54,B55,B56,B6,B62,B67,B68,B7,B70,B72,B75,B79,B8,B81,B88,B90,B92,B94,B95,B96,B98,C1,C11,C13,C18,C21,C25,C27,C29,C38,C39,C42,C45,C49,C54,C56,C6,C62,C69,C70,C74,C77,C78,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C87,D1,D4,D5
`Chr2:74738106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:74738149`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A1,B106,B34,B5,B84,C24,C31,C47,C50
`Chr2:74738287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:74738297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C80,D10
`Chr2:74738307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr2:74738313`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792678.1

402 aa

201

402

DUF674

PF05056 DUF674 4-97 aa PF05056 DUF674 100-264 aa PF05056 DUF674 317-361 aa PF05056 DUF674 319-393 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792678.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	4	97	1.2e-70	239.3	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057792678.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	100	264	1.2e-70	239.3	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057792678.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	317	361	1.2e-70	239.3	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057792678.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	319	393	1.2e-70	239.3	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936695.1
ATTTTCACAGCCTCTATAAAATTCGCTTGACCGCCCAAACTCTTGCGACTGCTGCTTTTCTCAATTCTCTGCAAACACTTCAAAGCAACTAAAATTCCCCAATTCGTAACAAGAGAATGTCTGAGGAGGAAGAAAAGATTCATGTCAAGTTAATAATGAATAAAGGGAAAACCAAGGTACTATTTGCAGAAGCCGGCAGCGATTTCGTAGACGCTTTGTTAAGCTTCCTGCCTCTTCCATTGGGAACGATTGTGAAGGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009392
ATGTCTGAGGAGGAAGAAAAGATTCATGTCAAGTTAATAATGAATAAAGGGAAAACCAAGGTACTATTTGCAGAAGCCGGCAGCGATTTCGTAGACGCTTTGTTAAGCTTCCTGCCTCTTCCATTGGGAACGATTGTGAAGGTCTTGAAGAAGCAGTTTGGAGAGAAGGTGCTCCTAGCTGGAAGCTTGAAAACTCTGTACAACGGCTTAGCAAATCTCGACACCATCCATTTCCTGACTGAGGATGCTAAGATCTTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792678.1
MSEEEEKIHVKLIMNKGKTKVLFAEAGSDFVDALLSFLPLPLGTIVKVLKKQFGEKVLLAGSLKTLYNGLANLDTIHFLTEDAKILLLNPTSLDEDEQLPLDEVFTETTASFIISDDLKVMRSVEGSVMSTLRSLGIAITDMDGAEIRDMHLGYAQMMTLMAIMFVSRNPLTTLLLLTLTRQAAGQGNAVNQIGKRAHCMNTKKISLTAMMQKSTNKLLFAQARHDFVSFLFGLLAIPLGRVEWFLHSNTGVRATDNLHR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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