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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005433`

染色体: Chr02 坐标: 74748855-74751590 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005433`
名称	SmilChr02G005433
描述	probable WRKY transcription factor 31
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74748855 - 74751590 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009394`
GeneID	`131009394`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009394`
原始查询	`LOC131009394`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 31
产物	probable WRKY transcription factor 31
Arabidopsis	`AT1G62300` (WRKY6) WRKY family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842527] identity=52; qcov=0.81; evalue=7.2e-135; confidence=high
Rice	`Os01g0289600` (OsWRKY9) - identity=47.2; qcov=0.452; evalue=3.39e-59; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009394

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792682.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792682.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792682.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792682.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792682.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74749095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:74749114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B25,C13,C74
`Chr2:74749154`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A11,A22,A4,B121,B139,B16,B28,B30,B36,B62,B70,B8,B93,C18,C21,C29,C39,C45,C49,C60,C77,D7
`Chr2:74749164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B13,B14
`Chr2:74749182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B44,C45
`Chr2:74749255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:74749271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B87
`Chr2:74749273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B45,B89
`Chr2:74749290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B120,C56
`Chr2:74749302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:74749308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B25,C13,C74
`Chr2:74749359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792682.1

591 aa

296

591

WRKY

PF03106 WRKY 302-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792682.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	302	359	3e-26	92.1	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936699.1
GGCGAGTCGTTTGCTATCTCGAAAAGACTTTGCCCATATTTTCTCTATCTTGTTTCCTTCAAGAATATATGGCCACACGAGGTGGACTCTCCTTTGATCCAGATCACCACAGTATCACCAGACTGTTTCACCATCAAGCCAAAACCCACTTCCACAATAACCAGCTCAAGCTCCAGCAGATTCTACCTAGGTTTCCAGCCCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCGCTCATGGACGCCCCCGTCAAGTCGCCGCCGACCACCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009394
ATGGCCACACGAGGTGGACTCTCCTTTGATCCAGATCACCACAGTATCACCAGACTGTTTCACCATCAAGCCAAAACCCACTTCCACAATAACCAGCTCAAGCTCCAGCAGATTCTACCTAGGTTTCCAGCCCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCGCTCATGGACGCCCCCGTCAAGTCGCCGCCGACCACCACCATCCAGTTCCCCGTCAGCCACGGCGATCACGGGAAGAGGAAGGTCCTCGACGAGATGGATTTCTTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792682.1
MATRGGLSFDPDHHSITRLFHHQAKTHFHNNQLKLQQILPRFPAPPPPSPPLMDAPVKSPPTTTIQFPVSHGDHGKRKVLDEMDFFADKNEGGGGGGRDDDEEENVGIEHHRLDFKVNTGLHLLTTANTGSEESGVDDGMSSIPENKRSKIEMAFLQSEMERMNSENARLKEMLDQMTNNYNGLQMHVLTMMHQRSDNQTGGATAEESKNGHDNGLLVPRQFMDLGFGGNEEGSLSPPEGRIGRDMPPAHDKDVVGGDEP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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