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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005435`

染色体: Chr02 坐标: 74764283-74769250 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005435`
名称	SmilChr02G005435
描述	probable protein S-acyltransferase 1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74764283 - 74769250 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009396`
GeneID	`131009396`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009396`
原始查询	`LOC131009396`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein S-acyltransferase 1
产物	probable protein S-acyltransferase 1
Arabidopsis	`AT3G56920` (AT3G56920) DHHC-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824859] identity=37.3; qcov=0.883; evalue=2.52e-61; confidence=medium
Rice	`Os12g0131200` - identity=36; qcov=0.923; evalue=4.17e-56; confidence=medium
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006612 (protein targeting to membrane); GO:0018230 (peptidyl-L-cysteine S-palmitoylation); GO:0019706 (protein-cysteine S-palmitoyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01529 (DHHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009396

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057792684.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057792684.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057792684.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057792684.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792684.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74767468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B70,C62
`Chr2:74767479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C80
`Chr2:74767495`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C40
`Chr2:74767495`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C40
`Chr2:74767543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,C27,C75,D9
`Chr2:74767755`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A13,A18,B108,B48,B58,C23
`Chr2:74767811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B135,B40,C53
`Chr2:74767813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C80
`Chr2:74767836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:74768247`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A3,B104,B11,B110,B9,C26,C44,C76,D8
`Chr2:74768291`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A11,B120,B140,B37,B49,B57,B62,B64,B7,B84,B99,C39,C51,C52,D4
`Chr2:74768296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792684.1

325 aa

162

325

DHHC

PF01529 DHHC 164-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792684.1`	Pfam	`PF01529`	DHHC	Family	164	282	1.3e-29	103.7	DHHC palmitoyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936701.1
AACTTCAAATAAAAATAAAAAAATTAAAAAAAATCCATAACTGTAAGTCAGTTGCGAAAACTTCATGGCGCCTTATCTCTACATTTGAACTCAAGATATATACGCACAGTTTCAACAGCAAAATCTCGCTGAAAACATCGAGAAAAATGGCTTCAACCGAATCCGACGCCAAAACGGAGTTCACAGCGGTTGAAAACGGAGAAACGAAAGCAAATCTCACCGTTTTACGACAACAGCTAGTTTCTGCGAAAAGGATTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009396
ATGGCTTCAACCGAATCCGACGCCAAAACGGAGTTCACAGCGGTTGAAAACGGAGAAACGAAAGCAAATCTCACCGTTTTACGACAACAGCTAGTTTCTGCGAAAAGGATTTTCAGCGAAAGGTTGCTCAAATCCTTTCACGGCGATCGAAGCGACGATCGCACGACGAGATTGTACCATGTTTGGCCCGGAAACAACGTATTTTTCTGCGGCGGCCGCCTCGTGTGCGGCCCCGATCCGAGAGGACTGGTGCTGACAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792684.1
MASTESDAKTEFTAVENGETKANLTVLRQQLVSAKRIFSERLLKSFHGDRSDDRTTRLYHVWPGNNVFFCGGRLVCGPDPRGLVLTTMAVVMSSWSFAAYVANDDVSRDSSVKIICCVILTFIVLVNLGVVSTIDPGIIPRSDRPLVESTTEEVEVEVEGIKVRLKYCRICNIYQTPRSHHCLVCDNCVEKFDRHCPLIGQCIGLRNYRLYVLFLFMALVFFAYICAFSLQKLGHKMAQNDVDLIVTFALASFSIGATLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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