当前解析结果
SmilChr02G005439| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005439 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005439 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G005439 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 74786173 - 74789076 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009404 |
|---|---|
| GeneID | 131009404 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009404 |
| 原始查询 | LOC131009404 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transmembrane protein, putative (DUF1068) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839330]; symbol=AT1G05070; hit=AT1G05070; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | transmembrane protein, putative (DUF1068) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839330]; symbol=AT1G05070; hit=AT1G05070; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G05070 (AT1G05070)transmembrane protein, putative (DUF1068) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839330] identity=65.9; qcov=0.989; evalue=3.06e-81; confidence=high |
| Rice | Os03g0777500 (OSJNBa0010I09.2)- identity=55.6; qcov=0.966; evalue=3.53e-60; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF06364 (DUF1068) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009404 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.60000 | XP_057792699.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057792699.1 |
| 3 | Growth cone | Growth cone | 0.20000 | XP_057792699.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792699.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792699.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:74786417 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B63,C72 |
Chr2:74786443 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057792699.1PF06364
DUF1068 7-169 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057792699.1 |
Pfam | PF06364 |
DUF1068 | Family | 7 | 169 | 7.9e-81 | 270.5 | Protein of unknown function (DUF1068) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。