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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005445`

染色体: Chr02 坐标: 74821409-74826421 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005445`
名称	SmilChr02G005445
描述	condensin complex subunit 2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74821409 - 74826421 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009408`
GeneID	`131009408`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009408`
原始查询	`LOC131009408`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	condensin complex subunit 2
产物	condensin complex subunit 2
Arabidopsis	`AT2G32590` (EMB2795) condensin complex subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817819] identity=57.3; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0532800` - identity=48.9; qcov=0.433; evalue=7.23e-79; confidence=low
GO	GO:0000796 (condensin complex); GO:0003682 (chromatin binding); GO:0007076 (mitotic chromosome condensation)
KEGG	-
Pfam	PF05786 (Cnd2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009408

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792703.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057792703.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057792703.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.80000	`XP_057792703.1`
5	Centromere	着丝粒	0.20000	`XP_057792703.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74821519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B100,B8,C15
`Chr2:74821531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:74821532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A24,A6,B112,B126,B131,B7,B94,C13,D5
`Chr2:74821552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B140,C24,C3,C78
`Chr2:74821554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C33
`Chr2:74821566`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A1,A22,A5,B100,B102,B104,B117,B128,B20,B28,B58,B64,B8,B99,C15,C16,C28,C4,C48,C49,C5,C54,C75,C86,D10,D7
`Chr2:74821574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C18
`Chr2:74821610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B29
`Chr2:74821610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr2:74821648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:74821665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,D11
`Chr2:74821670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792703.1

656 aa

328

656

Cnd2

PF05786 Cnd2 17-508 aa PF05786 Cnd2 535-651 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792703.1`	Pfam	`PF05786`	Cnd2	Family	17	508	3.7e-117	393.7	Condensin complex subunit 2
`XP_057792703.1`	Pfam	`PF05786`	Cnd2	Family	535	651	3.7e-117	393.7	Condensin complex subunit 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936720.1
AAACAGAGTTTCGAAAACCACTTTCAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTAAAATCTCTGGGAATTCCGGCCTCCGTCTGCAACCTGAAATGGGGGAAACCTTGAGCCCAATTTTGAAGCAAAGAGCTCCTCCATTTTCCCCGATAAAGAGCCCTCTGTTTGCAATAGGCTCCAACGACGACAAGCTCGAGCGGGCTCAGGCCCGCGCCGCACGCGCCGCCGCCATCCGCCGCAAGCCCACCGTCGTCTCCACCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009408
ATGGGGGAAACCTTGAGCCCAATTTTGAAGCAAAGAGCTCCTCCATTTTCCCCGATAAAGAGCCCTCTGTTTGCAATAGGCTCCAACGACGACAAGCTCGAGCGGGCTCAGGCCCGCGCCGCACGCGCCGCCGCCATCCGCCGCAAGCCCACCGTCGTCTCCACCTCCGTCTCGCCCGAGACCGACTCGTGTCTTGGGAAGGAACAGATCCTCGACTTGTTCCACAACTGCATCAAACTAGCCAGCGAAAATAAAATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792703.1
MGETLSPILKQRAPPFSPIKSPLFAIGSNDDKLERAQARAARAAAIRRKPTVVSTSVSPETDSCLGKEQILDLFHNCIKLASENKINQKNTWELTLIDHLCEIIKVEEEDDTETNFQKASCTLEAGVKIYSMRVDSVHSEAYKVLGGINRVGQEDEKDDAVEDGNVTAGQGEDDEKKEQGRKLSPLSTLESSFTAINVKKFDVAFVVDPLYHQTSAQFDEGGAKGLLLNNLGVYGNCQVLFDSLEVPGKCSSPVARDEGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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