当前解析结果
SmilChr01G003102| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003102 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003102 |
| 描述 | serine/arginine-rich splicing factor SC35-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 49835726 - 49836121 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009415 |
|---|---|
| GeneID | 131009415 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009415 |
| 原始查询 | LOC131009415 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | serine/arginine-rich splicing factor SC35-like |
| 产物 | serine/arginine-rich splicing factor SC35-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009415 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057792716.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057792716.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792716.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057792716.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057792716.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:49835738 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B82 |
Chr1:49835743 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C51,C73,C86 |
Chr1:49835909 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr1:49835921 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr1:49835974 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B139,C35,C4,C43 |
Chr1:49836013 |
TA |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | C51,C86 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。