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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005464`

染色体: Chr02 坐标: 74941020-74944148 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005464`
名称	SmilChr02G005464
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	74941020 - 74944148 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009426`
GeneID	`131009426`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009426`
原始查询	`LOC131009426`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=25.8; qcov=1.02; evalue=5.36e-68; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=31.1; qcov=0.615; evalue=3.77e-65; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009426

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057792725.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792725.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792725.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792725.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792725.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:74941097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B101,C85
`Chr2:74941141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C78
`Chr2:74941151`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A10,B101,B27
`Chr2:74941151`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A10,B101,B27
`Chr2:74941213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:74941278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:74941283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:74941306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr2:74941314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C14,C79
`Chr2:74941346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B45,B65,C14,C79
`Chr2:74941367`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	97	A14,A2,A21,A3,A6,A7,A9,B1,B10,B101,B103,B106,B11,B110,B113,B117,B120,B121,B123,B127,B130,B131,B132,B137,B139,B140,B16,B20,B26,B28,B3,B30,B37,B38,B41,B46,B5,B52,B53,B59,B6,B61,B62,B70,B71,B72,B73,B76,B8,B80,B81,B84,B89,B90,B93,B94,B95,B98,C10,C13,C14,C18,C2,C20,C22,C28,C29,C3,C32,C33,C34,C38,C41,C45,C46,C48,C50,C51,C52,C53,C56,C59,C60,C63,C68,C75,C76,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C85,D10,D5,D8
`Chr2:74941371`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	98	A14,A2,A21,A3,A6,A7,A9,B1,B10,B101,B103,B106,B11,B110,B113,B117,B120,B121,B123,B127,B130,B131,B132,B137,B139,B140,B16,B20,B26,B28,B3,B30,B37,B38,B41,B46,B5,B52,B53,B59,B6,B61,B62,B70,B71,B72,B73,B76,B8,B80,B81,B84,B89,B90,B93,B94,B95,B98,C10,C13,C14,C18,C2,C20,C22,C28,C29,C3,C32,C33,C34,C38,C41,C45,C46,C48,C50,C51,C52,C53,C56,C59,C60,C63,C68,C75,C76,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C85,C87,D10,D5,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792725.1

852 aa

426

852

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 161-323 aa PF23559 WHD_DRP 408-482 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792725.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	161	323	2.7e-39	135.2	NB-ARC domain
`XP_057792725.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	408	482	1.6e-18	67.2	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936742.1
GATTGGAAATTAATCTCATCTTCATTCACACTCATCTCGTATTCTCTCTGCAACTCCCAAAACAACCATGGCAGCAGCTTATGCAACTCTACTTTCTGCTTTGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCCCGCCCTCCTATTTCTCTCCCCATTCAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTGGAATTTCTCGAGGGGTATAACCCCCATCGTGGCTACTCCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009426
ATGGCAGCAGCTTATGCAACTCTACTTTCTGCTTTGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCCCGCCCTCCTATTTCTCTCCCCATTCAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTGGAATTTCTCGAGGGGTATAACCCCCATCGTGGCTACTCCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAACACGCCATTGAATCTCATATTTTCGATCAGTTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792725.1
MAAAYATLLSALNIINNLHHHPRPPISLPIQQVESLTQKINFLLEFLEGYNPHRGYSKEADPLESRIADAAYAAEHAIESHIFDQLTNNGENMSSDGLYEALEKVIEEMALIEEEAKQIQARVGVQHQLHTKSTTSDSSRSSSSSIPQQSSMVGADDVKLQLMDKLTSDRLHLQIIPIVGMGGSGKTTLARTIYEERLIKEHFDICAWATISQEYSIREMSAVVLRQFNIGVDDDLNEDGLGEKLYKHLYGRRYLIIMDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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