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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003114`

染色体: Chr01 坐标: 49951069-49952478 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003114`
名称	SmilChr01G003114
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49951069 - 49952478 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009433`
GeneID	`131009433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009433`
原始查询	`LOC131009433`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G58400` (AT1G58400) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842209] identity=23.4; qcov=1; evalue=3.63e-17; confidence=weak
Rice	`Os06g0286700` (Piz) - identity=25.2; qcov=1.11; evalue=3.81e-24; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792739.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057792739.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057792739.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792739.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792739.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49951094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:49951097`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	144	A10,A11,A13,A15,A18,A19,A20,A22,A23,A4,A6,A7,A9,B10,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B118,B122,B124,B125,B126,B129,B13,B130,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B14,B140,B16,B17,B20,B21,B22,B24,B26,B27,B3,B30,B31,B32,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B41,B45,B46,B47,B49,B52,B54,B57,B58,B59,B6,B61,B64,B65,B68,B69,B73,B74,B75,B77,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B94,B95,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C31,C33,C35,C36,C37,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C48,C49,C5,C51,C55,C56,C58,C59,C6,C64,C65,C66,C69,C72,C73,C75,C8,C80,C82,C84,C85,C86,C9,D4,D8,D9
`Chr1:49951112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B48,C81,D5
`Chr1:49951147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49951196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C48
`Chr1:49951200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C48
`Chr1:49951203`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A11,B126,B58,B80,C6,C63,C67,C87
`Chr1:49951267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:49951344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B79,C47,C76
`Chr1:49951432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B121,B25,B8,B93,C57
`Chr1:49951432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B25,B8,B93,C57
`Chr1:49951591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792739.1

469 aa

234

469

WHD_DRP

PF23559 WHD_DRP 3-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792739.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	3	73	6.3e-19	68.5	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936756.1
ATGGGAGTGTTTGAGGAAGATCGCTCAATTAGAGTCTCGAAACTGAACAAGCTATGGGTTTCTGAGGGTTTTCTTAAACCAAAAGATAACAAAAGCTTGGAAACAGTAGGTGAAGAGTACTTGAAGGAGCTAGTTGACAGAAATCTCATTCTTGTTCATAAATTGGGCTCACTTGGGAATATAAAACAATGCAAAATTCATGACTTATTGAGAGATTTGTCATTGAAAGAAGCTCAAAAGCAGAGGTTTTATTATGTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009433
ATGGGAGTGTTTGAGGAAGATCGCTCAATTAGAGTCTCGAAACTGAACAAGCTATGGGTTTCTGAGGGTTTTCTTAAACCAAAAGATAACAAAAGCTTGGAAACAGTAGGTGAAGAGTACTTGAAGGAGCTAGTTGACAGAAATCTCATTCTTGTTCATAAATTGGGCTCACTTGGGAATATAAAACAATGCAAAATTCATGACTTATTGAGAGATTTGTCATTGAAAGAAGCTCAAAAGCAGAGGTTTTATTATGTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792739.1
MGVFEEDRSIRVSKLNKLWVSEGFLKPKDNKSLETVGEEYLKELVDRNLILVHKLGSLGNIKQCKIHDLLRDLSLKEAQKQRFYYVPRQNSLEGIDAQRRVVIPKSTSKEKVLDALKSMSHARSYISEYRIVCELPDSRLLRMLNTFDKNVNSRTFSHNTQDVFQLVNSRFLALESFGDKHVSSSLSLLWNLHTLIVSSGDVIAPIEIWKMHQLRHVDFGYTDSLYLPDPPSSESDVIIMENLLTLKGVKNLYLNEEVVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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