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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005505`

染色体: Chr02 坐标: 75174159-75180089 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005505`
名称	SmilChr02G005505
描述	auxin response factor 6-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	75174159 - 75180089 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009443`
GeneID	`131009443`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009443`
原始查询	`LOC131009443`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin response factor 6-like
产物	auxin response factor 6-like
Arabidopsis	`AT1G19220` (ARF19) auxin response factor 19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838505] identity=58.1; qcov=0.564; evalue=4.98e-169; confidence=medium
Rice	`Os02g0164900` (OsARF6a) - identity=63.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009725 (response to hormone)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02309 (AUX_IAA); PF02362 (B3); PF06507 (ARF_AD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009443

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792746.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792746.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792746.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792746.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792746.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:75174384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B101,B140,C85
`Chr2:75174431`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C45
`Chr2:75174431`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C45
`Chr2:75174439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr2:75174492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B127,C10,C27,D11
`Chr2:75174556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B69
`Chr2:75174876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:75174978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:75174987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B5,B66,B81,B99
`Chr2:75175322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:75175373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B101,B104,B140,C85
`Chr2:75175391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B129,B132,B61,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792746.1

897 aa

448

897

ARF_AD

AUX_IAA

PF02362 B3 133-235 aa PF06507 ARF_AD 282-365 aa PF02309 AUX_IAA 751-845 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792746.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	133	235	1.1e-24	86.9	B3 DNA binding domain
`XP_057792746.1`	Pfam	`PF06507`	ARF_AD	Domain	282	365	1.3e-34	118.6	Auxin response factor ancillary domain
`XP_057792746.1`	Pfam	`PF02309`	AUX_IAA	Family	751	845	2.3e-09	38.1	AUX/IAA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936763.1
TTTGAAACTTGGAAACAAGATTGCAATAATTGATTATACTTTCCCAAATTACCTCCTCTGCTTCTTCAAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATAAACATTAATTCTGTTTTTGAAAGAAAAAGGAAAAGAAAAAGCCATTAAAGATCTGCAGCTCATTTTAGCTCCACGCAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGAGATCTCAATAGTTCACAAAAGCTACTCATCATTTTCTTCCTCGTTTGCTTTTGCTTCACTTAGTAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009443
ATGAGGTTGTCTTCTTCTTCTTCAACGGGTTCTGGATTTAATGCTCAGGCGGAGGAAGGGGAGAAGAAATGCTTGAATTCGGAGCTCTGGCACGCGTGTGCCGGCCCACTGGTGTCGCTTCCCCAGCTCGGGAGCCGCGTCGTTTATTTCCCTCAAGGCCACAGCGAGCAGGTTGCTGCCTCTACGAACAAGGAAGTAGACGGTGCTATCCCTAACTATCCCGGCTTGCAACCGCAACTAATATGCCAACTTCATAATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792746.1
MRLSSSSSTGSGFNAQAEEGEKKCLNSELWHACAGPLVSLPQLGSRVVYFPQGHSEQVAASTNKEVDGAIPNYPGLQPQLICQLHNVTMHADVETDEVYAQMTLQPLTPQEQKDICLLPSELGTPSKQPTNYFCKTLTASDTSTHGGFSVPRRAAEKVFPPLDYSQTPPAQELIAKDLHGNEWKFRHIFRGQPKRHLLTTGWSVFVSAKRLVAGDSVIFIWNENNQLFLGIRRANRPQTVMPSSVLSSDSMHIGLLAAAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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